Темы

C Cеквенирование E E1b1b G I I1 I2 J J1 J2 N N1c Q R1a R1b Y-ДНК Австролоиды Альпийский тип Америнды Англия Антропологическая реконструкция Антропоэстетика Арабы Арменоиды Армия Руси Археология Аудио Аутосомы Африканцы Бактерии Балканы Венгрия Вера Видео Вирусы Вьетнам Гаплогруппы Генетика человека Генетические классификации Геногеография Германцы Гормоны Графики Греция Группы крови ДНК Деградация Демография в России Дерматоглифика Динарская раса Дравиды Древние цивилизации Европа Европейская антропология Европейский генофонд ЖЗЛ Живопись Животные Звёзды кино Здоровье Знаменитости Зодчество Иберия Индия Индоарийцы Интеръер Иран Ирландия Испания Исскуство История Италия Кавказ Канада Карты Кельты Китай Корея Криминал Культура Руси Латинская Америка Летописание Лингвистика Миграция Мимикрия Мифология Модели Монголоидная раса Монголы Мт-ДНК Музыка для души Мутация Народные обычаи и традиции Народонаселение Народы России Наши Города Негроидная раса Немцы Нордиды Одежда на Руси Ориентальная раса Основы Антропологии Основы ДНК-генеалогии и популяционной генетики Остбалты Переднеазиатская раса Пигментация Политика Польша Понтиды Прибалтика Природа Происхождение человека Психология РАСОЛОГИЯ РНК Разное Русская Антропология Русская антропоэстетика Русская генетика Русские поэты и писатели Русский генофонд Русь США Семиты Скандинавы Скифы и Сарматы Славяне Славянская генетика Среднеазиаты Средниземноморская раса Схемы Тохары Тураниды Туризм Тюрки Тюрская антропогенетика Укрология Уралоидный тип Филиппины Фильм Финляндия Фото Франция Храмы Хромосомы Художники России Цыгане Чехия Чухонцы Шотландия Эстетика Этнография Этнопсихология Юмор Япония генетика интеллект научные открытия неандерталeц

Поиск по этому блогу

пятница, 21 июня 2013 г.

Структура населения Западной Евразии

Неделю назад Dienekes Pontikos опубликовал результаты статистического анализа аутосомных SNP-маркёров 871 образцов из 60 популяций Западной Евразии. Полученное деление на кластеры выявило предсказуемую структуру, которая, тем не менее, заслуживает самого пристального внимания.

Для тех, кто не хочет влезать глубоко в детали, сразу приведу структурную диаграмму с русскими, белорусами, поляками, литовцами и финнами, поставленными в один ряд с западными и южными европейцами.

В диаграмме отчётливо выделяются два ключевых компонента, один из которых доминирует у северо-восточных европейцев (оранжевый), второй — у северо-западных (розовый). Оба компонента выявляют связь не только с географическими областями, но и с языковыми семьями: первый строго совпадает со славянскими и балтскими языками, второй — с германскими и кельтскими. Показателен и контекст, в котором эти компоненты встречаются: первые почти идентичны финнам, вторые соседствуют с более пёстрыми по составу южными европейцами: итальянцами, испанцами, португальцами, французами (романские языки).


О чём всё это говорит? Со стороны популяционной генетики получено очередное подтверждение фактам, выявленным антропологами: всё население лесной зоны Северо-Восточной Европы родственно по своему происхождению и на протяжении многих тысяч лет не испытывало кардинальных влияний со стороны. Налицо разительное отличие как от западных, так и от южных европейцев, предки которых пришли в Европу ранними земледельцами и передали лесному населению земледелие в качестве технологии, без серьёзной демографической инфильтрации.

Отдельно, не удивляемся заметному финскому компоненту в серии Russian — она происходит из Вологды; серия Russian_D — средние по палате русские. Могут возникнуть сомнения по части репрезентативности популяций, но они очевидным образом снимаются после взгляда на выборки по народам, в которых отдельные образцы выглядят достаточно равномерными. Такие диаграммы составлены автором для каждой популяции по каждому кластерному анализу. Для русских она выглядит следующим образом.


Теперь доступно и подробно по делению всего исходного материала на кластеры количеством от 3 до 11.


Структурная диаграмма, построенная на основе SNP-маркёров, представляет собой массив исходных данных, где каждый столбец составляет отдельный образец, либо — в данном случае — сгруппированные в популяции средние значения по образцам. Деление на кластеры проводится машинным анализом сходства фрагментов SNP-маркёров при заранее заданном количестве кластеров. Другими словами, схожие последовательности отдельных образцов объединяются в кластеры и обозначаются своими цветами. Такого типа диаграмма однажды уже разбиралась на примере северных европейцев.

Теперь к данным от Dienekes.


Первая диаграмма с тремя кластерами (K=3) отчётливо выделяет три компонента: западно-евразийскийприсахарский и восточно-азиатский.

Присахарский компонент доминирует среди населения Северной и Северо-Восточной Африки, в остальном встречается большей частью среди арабов; фиксируется он малыми долями и в Европе: среди испанцев, французов и итальянцев. Восточно-азиатский компонент широко встречается у носителей финно-угорских и тюркских языков. Любопытно здесь то, что почти 40% популяции Indian_D приходится на долю восточно-азиатского компонента, оставляя западно-евразийскому только половину.

В целом, деление на три кластера повторяет распространение трёх расовых комплексов: негроидного, монголоидного и европеоидного.


Диаграмма при K=4 оставляет неизменными присахарский и восточно-азиатский компоненты, затрагивая исключительно западно-евразийский. Последний компонент строго распадается на две части: северо-европейский и западно-азиатский; географическая изменчивость обоих формирует клинальный градиент на всём перечне популяций.

При этом северо-европейский компонент оказывается полностью доминирующим у всех народов Северной Европы от русских и финнов до норвежцев и британцев, охватывая в том числе славяноязычных жителей Балкан (Balkans_D) и французских басков (French_Basque). Западно-азиатский компонент показывает максимум среди жителей Ближнего Востока и Малой Азии, охватывая побережье Средиземного моря: греки, итальянцы, сардинцы. Пространство между двумя очерченными областями образует смешанную зону, где один компонент плавно перетекает во второй: испанцы, французы, румыны, северные итальянцы. При этом у народов северо-востока Европы — финны, русские, литовцы, белорусы — западно-азиатский компонент практически отсутствует.

Ясное выделение в популяциях Западной Евразии западно-азиатского и северо-европейского компонентов также находит близкую аналогию в антропологии, совпадая с ареалами отчётливого проявления южно- и северо-европеоидных признаков.


На диаграмме K=5 присахарский и восточно-азиатский кластеры вновь остаются без изменения, а в двух западно-евразийских выделяется третий компонент: средиземноморский.

Для выяснения происхождения средиземноморского компонента следует понять, кто является его предшественником. Из сравнения K=4 и K=5 нетрудно заметить, что выделение средиземноморского компонента происходит не из какого-то одного — северо-европейского или западно-азиатского, — а одновременно из обоих, однако в разных областях — в различных пропорциях.

Так, среди ближневосточных и северо-африканский популяций (от Ethiopians до North_African_D, область доминирования западно-азиатского компонента при K=4) средиземноморский компонент практически полностью выделяется из западно-азиатского, оставляя долю северо-европейского почти без изменений. Любопытны здесь Индия и Пакистан, где северо-европейский компонент резко уступает западно-азиатскому.

Следующий интервал — от Finnish_D до Tuscan (доминирование северо-европейского компонента при K=4) — выделяет средиземноморский компонент приблизительно поровну из северо-европейского и западно-азиатского.

В оставшемся перечне — от C_Italian_D до Iranian_D (область клинального градиента при K=4) — вновь видно, что средиземноморский компонент замещает собой по большей части западно-евразийский компонент, оставляя долю северо-европейского относительно неизменным. Отдельного внимания заслуживают популяции балканских славян и французских басков, где при K=4 доминировал северо-европейский компонент: в них средиземноморский или не появляется вообще, или выделяется исключительно из западно-азиатского. Средиземноморский компонент вовсе не обнаруживается у сардинцев и марокканцев.

Таким образом, выделившийся при K=5 средиземноморский компонент показывает тесную связь со своим западно-азиатским предшественником. По своему происхождению он повторяет градиент, существующий между двумя западно-евразийскими компонентами при K=4: в зонах смешения и доминирования западно-азиатского выделяясь большей частью из западно-евразийского, и только в области доминирования северо-европейского выделяясь примерно поровну из обоих. Эта тенденция сохраняется вплоть до отдельных исключений из западно-азиатского массива: преимущественно северо-европейских по своей структуре популяций Balkans_D и French_Basque.

Сказанное означает, что полученный при K=5 средиземноморский компонент следует признать ответвлением западно-азиатского компонента (выявленного при K=4). При этом его существование в областях центра и севера Европы является результатом серьёзной и тесной метисации с северо-европейским компонентом.


Диаграмма с K=6 выделяет северо-африканский компонент.

Компонент частично обнаруживается на Ближнем Востоке, в Индии и Пакистане, средиземноморских областях Южной Европы. Подробно на нём можно не останавливаться.


На диаграмме K=7 становится ясно заметен компонент юго-западной Азии (светло-зелёный).

Этот компонент оказывается доминирующей примесью в популяциях Ethiopian и East_African_D. Вместе с западно-азиатским и средиземноморским компонентами он практически полностью формирует структуру ближневосточных популяций (Аравийский полуостров, Сирия, Ливан, иракские евреи), а также ряда сопредельных народов (грузины, армяне, киприоты, ассирийцы, турки, жители Ирана); занимает заметное место в генофонде греков, итальянцев, лезгинов, адыгейцев. В Европе он практически не встречается к северу от Иберийского, Апеннинского и Балканского полуостровов. Любопытно, что этот компонент встречается в Пакистане, но отсутствует в Индии.

Из-за непостоянства цветов у одних и тех же компонентов при различных K, тяжело разобраться, откуда по преимуществу выделяется компонент юго-западной Азии. Тщательное сравнение показывает, что большей частью компонент юго-западной Азии складывается поровну из западно-азиатского и средиземноморского.


Диаграмма при K=8 вносит значительные изменения в картину, наблюдавшуюся на более крупном масштабе.

В первую очередь это изменения в появлении отчётливого южно-азиатского компонента, который доминирует в Индии и Пакистане, частично затрагивает Иран, Узбекистан. Меньшая, но заметная доля по всему Ближнему Востоку и на Кавказе. В остальных регионах этот компонент или полностью отсутствует, или проявляется крайне незначительно.

Важной деталью анализа при K=8 является частичная перекройка распределения трёх компонентов: средиземноморского, западно-азиатского и юго-западно-азиатского. Популяции Северной Африки, Ближнего Востока и Южной Европы здесь по своей структуре обнаруживают заметную преемственность с предыдущей диаграммой, чего нельзя сказать о греках, популяциях Малой Азии и Кавказа (вниз, начиная от Adygei, исключая Balkans_D). Последних теперь полностью объединяет единый доминирующий западно-азиатский компонент, чья доля возросла за счёт поглощения частей средиземноморского и юго-западно-азиатского компонентов. Появление в регионе такой однородности обязано тому факту, что все его популяции несут в себе схожую по своей структуре комбинацию средиземноморского и юго-западно-азиатского компонентов, что отличает их как от носителей более чистого юго-западно-азиатского (Ближний Восток), так и более чистого средиземноморского (Южная Европа) компонентов.

Фактически, значительное упрощение диаграммы при K=8 означает обнаружение более простого способа кластеризации исходного материала. Вместе с этим, диаграмма частично теряет способность наглядно отражать доли каждого из исходных компонентов. Последнее, однако, ничуть не затрагивает те компоненты, чья структура до этого момента оставалась устойчивой и неизменной, а именно: присахарский и восточно-азиатский (появились при K=3), северо-европейский (появился при K=4), северо-африканский (появился при K=6).




Если с путаницей в цветах у отдельных компонентов до этого момента можно было жить, то при K=9 разбираться в ней становится невыносимо. После тщательного сравнения этой диаграммы с предыдущей можно выявить, что светло-оранжевый (южно-азиатский) компонент стал синим, а светло-голубой (средиземноморский) разделился на два: зелёный (условно-баски) и красный (условно-сардинцы).

Поскольку доли южно-азиатского и северо-европейского (оранжевый) компонентов остались неизменными по всем популяциям, то появляется возможность проследить критерий разделения средиземноморцев. Видно, что граница проходит между двумя отчётливыми полюсами:атлантическим и восточно-средиземноморским, поскольку первый практически не встречается в восточной части региона (Малая Азия, Ближний Восток, Балканы, Кавказ, запад Азии, везде доминирует красный), а второй — в западной (всё атлантическое побережье от Испании до Норвегии). При этом в Италии в значительной мере встречаются оба, но доминирует восточно-средиземноморский красный.

Диаграмма при K=10 интересна тем, что на ней впервые проявляется различие между северо-восточными европейцами: русскими, белорусами, литовцами и поляками — с одной стороны; немцами, скандинавами, британцами и другими северо-западными европейцами— с другой.

Однако, характер изменений по сравнению с K=9, а именно — сохранение структуры северо-восточных народов, которое особенно наглядно проявляется у литовцев и чувашей, даёт серьёзные основания предполагать, что признаком северо-западных европейцев выступает не единый исходный компонент, а свойственная для них общая по своей структуре комбинация компонентов. Другими словами, различие между северо-западными и северо-восточными европейцами реально существует, но причины различия не одинаковы: у первых — это доминирование общего очень древнего компонента, у вторых — сложившаяся на определённом этапе характерная структура генофонда.

За пределами северо-европейских популяций любопытно распространение характерных для них признаков среди других народов. Так, соотношение северо-восточного и северо-западного компонентов в некоторых популяциях следующее: греки — 1.2, индусы — 1.8, узбеки — 2.9, пакистанцы — 6.5, коренные народы севера Сибири — 14.2. Такое соотношение красноречиво подтверждает археологические заключение о древней миграции населения из Восточной Европы в евразийские степи.

Другой интересной деталью является структура финской популяции, занимающей промежуточное положение между скандинавами, славянами и балтами. Она показывает, что финны: а) формировались на сходной с северо-восточными европеоидами основе (авторитетно подтверждается антропологией), б) испытали значительное влияние со стороны скандинавов, в) несут малый (около 5%), но ощутимый восточно-азиатский компонент.
Как любой материал из области популяционной генетики, рассмотренные выше данные не привязываются к каким бы то ни было строгим временным датировкам, однако дают серьёзные возможности анализа последовательности событий. В качестве наглядного резюме можно построить диаграмму выделения и формирования компонентов по ходу увеличения кластеров.
Полный комплект результатов от Dienekes Pontikos: состав популяцийдиаграммы.

Другие записи в этом направлении доступны по тегам или по списку:
— Структура генофонда Швеции;
— Антропология и приход земледелия в Европу;
— Генетика о древнем населении Европы, мтДНК;
— Веское слово генетики о происхождении западных европейцев;
— Антропология древних балтов;
— Финно-угры ли русские?
http://drfaust-spb.livejournal.com/137312.html