Оригинал взят у
galicarnax в Несусветное (наследие Чаргаффа продолжается)
galicarnax в Несусветное (наследие Чаргаффа продолжается)
Когда я писал о втором правиле Чаргаффа (раз и два), я показал, что его можно расширить на геномы однонитевых и РНК-вирусов и плазмид (т.е. эти геномы тоже удовлетворяют правилу, просто ошибка большая). Я сделал это на глаз качественно, не дошли руки навести статистику количественно. Вот попалась статья, в которой народ эту статистику навел. Причем сделали хитро - они сразу проверили все возможные корреляции, т.е. не только между A и T, G и C, но и между A и G и т.п. Проверили они чуть ли не все доступные геномы.
И вот че пишут (дословный перевод):
Второе правило Чаргаффа выполняется в четырех из пяти рассмотренных типов dsDNA-геномов: бактериальных, архейных, ядерных эукариотных и вирусных, но нарушается в геномах органелл. В последних применимо другое правило: в первом приближении A + G = C + T = 0.5. Это правило выполняется автоматически и в других геномах как математическое следствие второго правила Чаргаффа, но также оно выполняется в однонитевых ДНК-вирусах, где второе правило Чаргаффа нарушается. Для вирусов с частично двунитевым геномом второе правило Чаргаффа выполняется только для пары GC. Почему примерное равенство пуринов и пиримидинов в этих геномах имеет место - неясно.
Неужели первичным фактом является A+G ≈ C+T, а второе правило Чаргаффа является лишь частным его случаем? Третье правило Чаргаффа, чтоле? Если для объяснения равенств A ≈ T, G ≈ C можно хотя бы инверсии за уши притянуть, то равенство T+C ≈ A+G не лезет ни в какие ворота.
Надо заметить, выражение "в первом приближении" звучит крайне занятно в биологической статье. Хорошо бы получить второе и более высокие приближения.
И вот че пишут (дословный перевод):
Второе правило Чаргаффа выполняется в четырех из пяти рассмотренных типов dsDNA-геномов: бактериальных, архейных, ядерных эукариотных и вирусных, но нарушается в геномах органелл. В последних применимо другое правило: в первом приближении A + G = C + T = 0.5. Это правило выполняется автоматически и в других геномах как математическое следствие второго правила Чаргаффа, но также оно выполняется в однонитевых ДНК-вирусах, где второе правило Чаргаффа нарушается. Для вирусов с частично двунитевым геномом второе правило Чаргаффа выполняется только для пары GC. Почему примерное равенство пуринов и пиримидинов в этих геномах имеет место - неясно.
Неужели первичным фактом является A+G ≈ C+T, а второе правило Чаргаффа является лишь частным его случаем? Третье правило Чаргаффа, чтоле? Если для объяснения равенств A ≈ T, G ≈ C можно хотя бы инверсии за уши притянуть, то равенство T+C ≈ A+G не лезет ни в какие ворота.
Надо заметить, выражение "в первом приближении" звучит крайне занятно в биологической статье. Хорошо бы получить второе и более высокие приближения.