Eщё в 1999 г. А.Ф. Назарова провела анализ частот аллелей ряда генетических маркеров у алтайцев и ряда народов Сибири, и показала, что эти частоты можно группировать как «европеоидные», «монголоидные» и промежуточные между ними. Например, генетические частоты по локусу GC2 (белка, связывающего витамин D) для очевидных европеоидов шведов (0.28), шотландцев (0.29), сербов (0.30), русских (0.32), чехов (0.32), англичан (0.29), французов (0.27), итальянцев (0.26), басков (0.31), поляков (0.34), немцев (0.29) равны в среднем 0.З0±0.02 (данные А.Ф. Назаровой). Напротив, соответствующие частоты у явных монголоидов - якутов (0.17), монголов (0.20), ненцев (0.21), удмуртов (0.24), вьетнамцев (0.20),чукчей (0.22), эскимосов Америки (0.17), манси (0.19), японцев (0.23), китайцев (0.24), лопарей (0.23) равны в среднем 0.21 ±0.03. Сюда же попадают финны - 0.22. В то же время для алтайцев этот показатель равен 0.26. Что похоже на переходную форму.
Ещё пример - генетические частоты по локусу НР1 (гетерохроматинового белка 1) для тех же групп - шведов (0.40), шотландцев (0.36), сербов (0.39), русских (0.39), чехов (0.36), англичан (0.41), французов (0.39), итальянцев (0.37), басков (0.44), поляков (0.36), немцев (0.41) равны в среднем 0.39±0.03 (данные А.Ф. Назаровой), в то время как соответствующие частоты у монголоидов - якутов (0.32), монголов (0.29), ненцев (0.26), удмуртов (0.27), вьетнамцев (0.29),чукчей (0.31), эскимосов Америки (0.35), манси (0.41), японцев (0.24), китайцев (0.30), лопарей (0.59) равны в среднем 0.30±0.05 (без лопарей) или 0.33±0.10 (с лопарями). Финны по этому показателю (0.36) тяготеют скорее к «европеоидным» частотам. А у алтайцев - 0.34, опять переходная форма.
Как видно из приведенных данных, «европеоидность» или «монголоидность» частот по отдельных локусам может иметь место, но попадаются исключения, свидетельствующие или о «смазанности» показателей (ведь эти показатели брались у современных людей, порой с перемешанными генами разных популяций за прошедшие тысячелетия и десятки тысяч лет), или о тривиальных погрешностях определений, которые никогда нельзя исключать полностью.
Кстати, следует отметить, что в этом контексте гаплогруппа Y-хромосомы является «бинарной» - либо она одна, либо другая и сохраняется десятки тысяч лет без изменений. Нет и не может быть смешанных гаплогрупп Y-хромосомы. Это -метка навечно и истребляется только со своим носителем. В этом смысле гаплогруппа Y-хромосомы всегда сопровождает потомков древнейших людей и передвигается вместе с ними. Она может вытесняться другой гаплогруппой, но тогда становится древнейшей меткой той, другой гаплогруппы. С другой стороны, она не отражает именно перемешиваемости генов, их сегодняшнего состояния, причём как мужчин, так и женщин, как отражают генетические частоты. Как мы видим, информация по генетическим частотам и по гаплогруппам-гаплотипам Y-хромосомы является взаимно дополняющей.
Именно потому, что отдельные локусы могут давать «смазанную» информацию, смазанную постепенным стиранием расовых и других различий, в литературе разработан метод «генетических расстояний», в котором частоты по отдельным локусам суммируются, усредняются, и приводятся к единой шкале [Nei, 1971, 1972, 1973, 1974, 1977, 1978; Nozawa et al, 1982; Ward and Skribinski, 1985; Cavalli-Sforza et al, 1971, 1988]. Это даёт показатель под названием «генетическое расстояние» между популяциями, и принимается за меру временной дистанции от их общего предка.
В работах А.Ф. Назаровой была создана матрица генетических расстояний, вычисленных по 28 аллелям двенадцати локусов белков, ферментов и групп крови [Назарова, 1999, 2002, 2005; Nazarova, 2006, 2008, 2009a, 2009b], и расчёт генетических расстояний проводился по методу [Cavalli-Sforza and Bodmer, 1971], в котором генетические расстояния рассчитываются как «угол расхождения популяций», в виде усреднённого отношения функции суммы «генетических расстояний» по каждому локусу и суммарному числу аллелей в локусах. Эти данные были рассчитаны для 11, и далее 55 популяций Европы, Азии и Америки.
Oтметим, что на основании полученных данных А.Ф. Назарова ещё в 1999 году выдвинула гипотезу о происхождении европеоидов, северных монголоидов и американских индейцев из одной древней пра-популяции, озаглавив свою статью «Гeнетические данные к проблеме дифференциации северных монголоидов, европеоидов и америндов на территории Евразии» [Назарова, 1999]. Эти же данные и выводы суммированы в её книге «Генетический портрет народов мира» (М., Липецкое изд-во, 2010), в главе «Популяции, переходные между монголоидами и европеоидами, и возможный путь формирования европеоидов».
В подтверждение своей концепции А.Ф. Назарова привлекает литературные данные о полиморфизме митохондриальной ДНК у народов Евразии и американских индейцев, а также данные палеогеографии, палеолингвистики и палеозоологии. Как видно из данных приведённых выше в настоящем разделе, эта гипотеза через 10 лет блестяще подтвердилась с помощью совершенно независимых данных, основанных на анализе гаплогрупп Y-хромосомы, а именно сводной гаплогруппы NOP, из которой произошли и монголоиды (гаплогруппа N), и европеоиды (гаплогруппа R), и американские индейцы (гаплогруппа Q).
Видимо, типичными представителями самых древних европеоидов являются скандинавы - шведы, норвежцы, датчане, исландцы, у которых к тому же преобладает гаплогруппа I1 (48%, 42%, 34% и 33%, соответственно). Это - северные европеоиды. Свидетельством размывания расовых признаков является немалая доля этой гаплогруппы у финнов - от древних 100% гаплогруппы N у них осталось (по регионам) от 62 до 77% N, и уже четверть Y-хромосомного пула заняла гаплогруппа I1 (20 - 26%). Иначе говоря, у финнов идёт заметный дрейф от монголоидной гаплогруппы N.
Ещё два типа европеоидов - средние и южные - представлены в разных переходных вариантах носителями гаплогруппы R1a1 (типичные представители - большинство русских, поляков, украинцев, белорусов, словаков, чехов, венгров) и R1b (типичные представители - ирландцы, испанцы, баски, французы, датчане, половина немцев, две трети итальянцев). Очевидно, что во втором типе перемешаны средние и южные европеоиды.
Ещё два типа европеоидов - средние и южные - представлены в разных переходных вариантах носителями гаплогруппы R1a1 (типичные представители - большинство русских, поляков, украинцев, белорусов, словаков, чехов, венгров) и R1b (типичные представители - ирландцы, испанцы, баски, французы, датчане, половина немцев, две трети итальянцев). Очевидно, что во втором типе перемешаны средние и южные европеоиды.