Темы

C Cеквенирование E E1b1b G I I1 I2 J J1 J2 N N1c Q R1a R1b Y-ДНК Австролоиды Альпийский тип Америнды Англия Антропологическая реконструкция Антропоэстетика Арабы Арменоиды Армия Руси Археология Аудио Аутосомы Африканцы Бактерии Балканы Венгрия Вера Видео Вирусы Вьетнам Гаплогруппы Генетика человека Генетические классификации Геногеография Германцы Гормоны Графики Греция Группы крови ДНК Деградация Демография в России Дерматоглифика Динарская раса Дравиды Древние цивилизации Европа Европейская антропология Европейский генофонд ЖЗЛ Живопись Животные Звёзды кино Здоровье Знаменитости Зодчество Иберия Индия Индоарийцы Интеръер Иран Ирландия Испания Исскуство История Италия Кавказ Канада Карты Кельты Китай Корея Криминал Культура Руси Латинская Америка Летописание Лингвистика Миграция Мимикрия Мифология Модели Монголоидная раса Монголы Мт-ДНК Музыка для души Мутация Народные обычаи и традиции Народонаселение Народы России Наши Города Негроидная раса Немцы Нордиды Одежда на Руси Ориентальная раса Основы Антропологии Основы ДНК-генеалогии и популяционной генетики Остбалты Переднеазиатская раса Пигментация Политика Польша Понтиды Прибалтика Природа Происхождение человека Психология РАСОЛОГИЯ РНК Разное Русская Антропология Русская антропоэстетика Русская генетика Русские поэты и писатели Русский генофонд Русь США Семиты Скандинавы Скифы и Сарматы Славяне Славянская генетика Среднеазиаты Средниземноморская раса Схемы Тохары Тураниды Туризм Тюрки Тюрская антропогенетика Укрология Уралоидный тип Филиппины Фильм Финляндия Фото Франция Храмы Хромосомы Художники России Цыгане Чехия Чухонцы Шотландия Эстетика Этнография Этнопсихология Юмор Япония генетика интеллект научные открытия неандерталeц

Поиск по этому блогу

пятница, 24 января 2014 г.

Ещё раз о ДНК-Генеалогии

По классическому определению генеалогии, генеалогия это вспомогательная отрасль истории, посвященная изучению истории рода. До последнего времени генеалогия могла опираться только на документальные источники, но неожиданно, несколько лет назад на помощь в изучении родов пришла генетика.
Каждый человек несет в себе записные генеалогические книжки - Y хромосому и mtDNA. В Y хромосоме записаны сведения о всех поколениях предков по мужской линии, а в mtDNA ведется запись поколениях о материнской линии.


Популярно об Y хромосоме


У каждого человека имеются 23 пары хромосом в которых записана вся генетическая информация доставшаяся от родителей. Хромосомы образуются в момент зачатия путем кроссверинга (перекреста), каждая берет половину от материнской хромосомы и половину от отцовской, что конкретно достанется от мамы, а что от папы - не известно, все решает случай.
В этой лотереи не участвует только одна мужская хромосома – Y, она целиком передается от отца к сыну как эстафетная палочка. Надо отметить, что у женщин ее нет вообще.

С каждым новым поколением в каких-то участках хромосомы - локусах, происходят мутации, именно благодаря этим мутациям становится возможным реконструировать рода. локусов в хромосоме несколько сот.

Пока непонятно зачем, но природа почему-то многократно дублирует генетическую информацию записанную в локусах. Повторов бывает от 5 до 40. Раз в несколько поколений в каждом локусе происходит мутация, количество повторов вдруг уменьшается на 1-2 повтора или увеличивается.

Например в нижеприведенном локусе девять раз повторяется запись ТСТА. В научной литературе такие повторяющиеся записи называются короткими тандемными повторами или STR (Short Tandem Repeat).

Анализ Y-хромосомы выявляет точное количество STR повторов в локусах. Локус с известным количеством повторов называется генетическим маркером. ДНК подпись человека представляет собой ряд цифр - маркеров. В верхней строчке нижерасположенной таблицы показаны наименование локусов, в нижней - количество повторов в локусах. Например DYS393 со значением 13, это уже генетический маркер.

 
MarkersDYS 393DYS 390DYS 19DYS 391DYS 385aDYS 385bDYS 426DYS 388DYS 439DYS 389iDYS 392DYS 389ii
Ваша подпись132516101114121210131130


В ДНК подписи принят определенный порядок следования маркеров, поэтому запись
13 25 16 10 11 14 12 12 10 13 11 30 никого не смущает, все знают, что первая цифра 13 это маркер локуса DYS 393, а вторая - маркер локуса DYS 390.

В настоящее время в ДНК-Генеалогии используются длинные ДНК подписи в 67 маркеров. 67 маркерная ДНК подпись уникальна, в точности она может встречаться только у близких родственников по мужской линии. Уже у троюродных братьев в одном из 67 локусов будет наблюдаться расхождение в количестве повторов, то есть, по одному маркеру их днк подписи не совпадут.

Прибавление или уменьшение количества повторов в разных локусах происходит с различной частотой. Есть маркеры быстро мутирующие, где одна мутация в среднем случается раз в 50 поколений, а есть медленно мутирующие, с скоростью одна мутация на 1000 поколений.

Известность скоростей мутации позволяет расчитывать время жизни первого общего предка (TMRCA) любой пары человек. Для коротких 12 маркерных подписей одно расхождение между двумя ДНК-подписями означает удаленность жизни общего предка в 40 поколений, то есть 1000 – 1200 лет тому назад.

 
ID / DYS39339019391385a385b426388439389i392389ii
Брат 1132516101114121210131130
Брат 2132515101114121210131130
Не брат162316121012111011121227
Distance from reference:ZeroOneTwoThree+


Сделав анализ своей Y хромосомы, и поместив полученную ДНК-подпись в мировую базу ysearch.org Вы найдете массу братьев с разной степенью генеалогической удаленности от Вас. С наиболее близкими братьями, от 15 и ближе поколений до общего предка, можно установить контакт, и узнать от них о новых ветвях своего родового древа. База данных постоянно расширяется, и в ней предусмотрен механизм автоматического информирования о появлении новых членов рода.

Использование результатов анализа "женской" мтДНК имеет свою специфику, но в целом похоже на методологию Y-хромосомы.
Митохондриальная мтДНК
В каждой клетке имеется масса маленьких структур называемых митохондриями, они занимаются выработкой энергии. Каждая из митохондрия имеет собственную ДНК которая получила название митохондриальная ДНК или сокращенно мтДНК.

мтДНК передается от матери к ребенку. Поскольку только женщины могут передавать мтДНК своим потомкам, тестирование мДНК дает информацию о матери, ее матери и так далее по прямой материнской линии. мтДНК от матери получают как мужчины, так и женщины, по этой причине в проведении тестирования мтДНК могут принимать участие и мужчины, и женщины.

Хотя в мтДНК и происходят мутации, их частота относительно низка. В течении тысячелетий данные мутации накапливались, и по этой причине женская линия в одной семье генетически отличается от другой. После того, как человечество расселилось по планете, мутации продолжили случайное появление в разделенных растоянием популяциях некогда единого человеческого рода. По этой причине мтДНК можно использовать для определения географического происхождения данной семейной группы.
Результаты тестирование мтДНК сравниваются с так называемой Станадртной Кембриджской последовательностью (CRS). Путем сравнения последовательности мтДНК с CRS мы можем идентифицировать древнюю родовую линию, к которой Вы принадлежите и которая называется гаплогруппой. Многие гаплогруппы "континент-специфические", а некоторые из их боковых ответвлений — "регион-специфические". Для практической генеалогии создана мировая база мтДНК подписей Mitosearch.org, где можно найти своих близких родственников по мт гаплогруппе.

Гаплогруппы мтДНК
Гаплогруппы именуются по алфавиту. В настоящее время антропологи определили конкретные гаплогруппы, которые произошли из Африки, Европы, Азии, островов в Тихом океане, обеих Америк, а также некоторые этнические группы. Конечно, гаплогруппы, специфические для данного региона, могут быть обнаружены и в другой области, но это является последствием недавней миграции.

Сегодня ДНК-Генеалогия стала широко применяться в практике генеалогического поиска, она позволяет "пробивать" архивные стены, тогда, когда нужные метрические книги утрачены, или их не выдают исследователям из-за ветхости. ДНК-Генеалогия значительно расширяет генеалогические древа за счет присоединения найденных ею ранее неизвестных ветвей, в итоге, наши куцые и голые древца преображаются в могучие и раскидистые родовые древа.
Кроме вклада в практическую генеалогию ДНК-Генеалогия во взаимодействии с Археологией, Лингвистикой, и Генографией значительно расширяет наши знания об истории человечества .
Год назад исползуя методы филогении и кладистики российские ДНК-Генеалоги первыми в мире начали детальные реконструкции древних родов - гаплогрупп. Процесс напоминает складывание картины из пазлов, в нашем случае пазлы это ДНК-подписи. Теперь, любой желающий может увидеть себя на древе своего древнего рода в окружении знаментиых собратьев.
Практически, за последние несколько лет произошло разделение Генеалогии на две взаимодополняющие друг друга части - традиционную Документальную Генеалогию (ДОК-Генеалогию), и опирающуюся на генетику ДНК-Генеалогию.