Оригинал взят у 
drfaust_spb в Первый геном человека верхнего палеолита
drfaust_spb в Первый геном человека верхнего палеолита
На прошедшей неделе в журнале Nature опубликовано исследование, посвящённое связи коренного населения Америки и Евразии. Выводы оказались ожидаемыми, но от того не менее интересными.
Три вопроса, по которым до недавнего времени не было ясности это:
1) в самом ли деле коренные американцы являются потомками переселенцев из Юго-Восточной Азии — здесь были сомнения у антропологов, учитывая нетипичный для монголоидов облик части индейцев;
2) в результате каких процессов случилось так, что гаплогруппы Y-ДНК R (доминирует у европецев) и Q (доминирует у коренных американцев), которые происходят из единой гаплогруппы P, оказались на разных континентах;
3) что за люди населяли Сибирь в древности.
Это исследование связывает воедино многое из того, что не было ясно ранее. Оно посвящено расшифровке генома жителя Прибайкалья (Mal’ta, MA-1), останки которого датируются верхним палеолитом — 24000 лет до н.э.; это самый древний геном человека современного типа, расшифрованный к настоящему времени.
Диаграммы и перевод фрагментов.
На следующую карту нанесено глобальное распределение оценки близости образца MA-1 со 147 современными популяциями. Красноречивы значения для севера Европы, Сибири, запада Евразии с одной стороны, востока Азии, Ближнего Востока — с другой.
Диаграмма ADMIXTURE демонстрирует детали (большой размер по клику). Кластерный анализ разделил современные глобальные вариации на 9 условных компонентов. Из этих компонентов у образца MA-1 доминируют три: 37% — Южная Азия, 34% — Европа, 26% — коренные жители Америки; оставшиеся 4% приходятся на долю Океании.
Резюмируя: до определённого времени Европа и Сибирь были заселены общими предками современных европейцев, коренных американцев и жителей юга Азии. Восточно-азиатский (монголоидный) и ближневосточный компоненты были принесены в Европу и Сибирь позже. Говоря в терминах антропологии, в образце MA-1 виден ранний европеоид, который уже чётко отделён от монголоидов, негроидов и австралоидов.
Не менее любопытные результаты дал анализ Y-ДНК образца MA-1 (слева).
Он обнаружил линию гаплогруппы R более древнюю по отношению к современным и при этом близкую к точке расхождения гаплогрупп R и Q. Гаплогруппа Q характерна для современных коренных американцев (распределение в Евразии на карте справа, B). Гаплогруппа R (справа, A) сегодня доминирует среди европейцев и её доля высока на севере Индии, в Афганистане, Таджикистане. Принимая в расчёт аутосомные данные, мтДНК и Y-ДНК, человек MA-1 вполне сошёл бы за современного европейца.
Данные по Y-ДНК уточняют картину, которая была обозначена выше. Популяция, из которой происходит образец MA-1, фиксирует момент разделения гаплогрупп R и Q, которые ранее и в последующее время занимают Европу, Западную Сибирь и в целом Западную Евразию — R; Восточную Сибирь, Америку — Q. Гаплогруппы N и O приходят на эти территории с юго-востока позже — на Урал и в Сибирь (N), в Центральную Азию (O). Последнее верно и в отношении современных популяций Ближнего Востока, Кавказа, Северной Африки и Средиземноморья.
Публикация на сайте Nature:
Raghavan et al., Upper Palaeolithic Siberian genome reveals dual ancestry of Native Americans, Nature, (2013), Published online 20 November 2013, doi:10.1038/nature12736
Обзор с обсуждением в блоге Eurogenes:
First genome of an Upper Paleolithic human
И пара ссылок по связи между европейцами/индейцами от Eurogenes:
Surprising aDNA results from Paleolithic Siberia (including Y-DNA R),
Ancient European admixture in the Americas, or ancient Amerindian admixture in Europe?.
Три вопроса, по которым до недавнего времени не было ясности это:
1) в самом ли деле коренные американцы являются потомками переселенцев из Юго-Восточной Азии — здесь были сомнения у антропологов, учитывая нетипичный для монголоидов облик части индейцев;
2) в результате каких процессов случилось так, что гаплогруппы Y-ДНК R (доминирует у европецев) и Q (доминирует у коренных американцев), которые происходят из единой гаплогруппы P, оказались на разных континентах;
3) что за люди населяли Сибирь в древности.
Это исследование связывает воедино многое из того, что не было ясно ранее. Оно посвящено расшифровке генома жителя Прибайкалья (Mal’ta, MA-1), останки которого датируются верхним палеолитом — 24000 лет до н.э.; это самый древний геном человека современного типа, расшифрованный к настоящему времени.
Диаграммы и перевод фрагментов.
Генетический анализ MA-1 показал, что его гаплогруппа митохондриальной ДНК — U, которая в финальном палеолите и мезолите полностью покрывала Европу и Западную Сибирь, а также лежит в основе современного населения этой территории и близка к корням современных американских индейцев.
Схожие результаты дал аутосомный анализ: он выявил сходство с современным населением запада Евразии и тесную связь с коренными американцами, но не обнаружил сходства с населением Восточной Азии. Это означает, что популяции, связанные с современным населением запада Евразии, в древности были расселены намного севернее и восточнее, чем предполагалось ранее. По полученным данным, от 14% до 38% предков коренных американцев восходят к популяции, к которой принадлежал человек MA-1. Секвентирование образца Afontova Gora-2 из того же региона Южной Сибири и датируемого около 17000 лет до н.э., дало схожие с MA-1 результаты аутосомного анализа, что указывает на непрерывность присутствия людей на этой территории в период последнего оледенения.
Всё это указывает на то, что западно-евразийский отпечаток в ДНК современных американских индейцев происходит не только из эпохи Колумба, как считалось ранее, а восходит к людям первыми заселившим Америку.
На следующую карту нанесено глобальное распределение оценки близости образца MA-1 со 147 современными популяциями. Красноречивы значения для севера Европы, Сибири, запада Евразии с одной стороны, востока Азии, Ближнего Востока — с другой.
Диаграмма ADMIXTURE демонстрирует детали (большой размер по клику). Кластерный анализ разделил современные глобальные вариации на 9 условных компонентов. Из этих компонентов у образца MA-1 доминируют три: 37% — Южная Азия, 34% — Европа, 26% — коренные жители Америки; оставшиеся 4% приходятся на долю Океании.
Наиболее сходной с образцом MA-1 структурой обладают жители Северной и Восточной Европы как ближайшие преемники автохтонного палеолитического/мезолитического населения, а также некоторые популяции Южной Азии — в сумме в MA-1 доля их компонентов составляют 70%. Такая структура может быть интерпретирована как смешение европейского и южно-азиатского компонентов в MA-1; либо наоборот — как первичный, древний и не дифференцированный компонент, который позже разделился на два. Результат структурного анализа не позволяет однозначно указать на один из этих двух сценариев.
Наиболее весомым из оставшихся является компонент современных коренных американцев (розовый и оранжевый). Примечательно то, что что в образце MA-1 отсутствуют компоненты, характерные для современного населения Юго-Восточной Азии и Сибири (два оттенка жёлтого). На этом основании можно предположить, что современный генетический ландшафт Сибири был сформирован в результате более поздних миграций из Юго-Восточной Азии.
Резюмируя: до определённого времени Европа и Сибирь были заселены общими предками современных европейцев, коренных американцев и жителей юга Азии. Восточно-азиатский (монголоидный) и ближневосточный компоненты были принесены в Европу и Сибирь позже. Говоря в терминах антропологии, в образце MA-1 виден ранний европеоид, который уже чётко отделён от монголоидов, негроидов и австралоидов.
Не менее любопытные результаты дал анализ Y-ДНК образца MA-1 (слева).
Он обнаружил линию гаплогруппы R более древнюю по отношению к современным и при этом близкую к точке расхождения гаплогрупп R и Q. Гаплогруппа Q характерна для современных коренных американцев (распределение в Евразии на карте справа, B). Гаплогруппа R (справа, A) сегодня доминирует среди европейцев и её доля высока на севере Индии, в Афганистане, Таджикистане. Принимая в расчёт аутосомные данные, мтДНК и Y-ДНК, человек MA-1 вполне сошёл бы за современного европейца.
Данные по Y-ДНК уточняют картину, которая была обозначена выше. Популяция, из которой происходит образец MA-1, фиксирует момент разделения гаплогрупп R и Q, которые ранее и в последующее время занимают Европу, Западную Сибирь и в целом Западную Евразию — R; Восточную Сибирь, Америку — Q. Гаплогруппы N и O приходят на эти территории с юго-востока позже — на Урал и в Сибирь (N), в Центральную Азию (O). Последнее верно и в отношении современных популяций Ближнего Востока, Кавказа, Северной Африки и Средиземноморья.
Публикация на сайте Nature:
Raghavan et al., Upper Palaeolithic Siberian genome reveals dual ancestry of Native Americans, Nature, (2013), Published online 20 November 2013, doi:10.1038/nature12736
Обзор с обсуждением в блоге Eurogenes:
First genome of an Upper Paleolithic human
И пара ссылок по связи между европейцами/индейцами от Eurogenes:
Surprising aDNA results from Paleolithic Siberia (including Y-DNA R),
Ancient European admixture in the Americas, or ancient Amerindian admixture in Europe?.
