Темы

Австролоиды Альпийский тип Америнды Англия Антропологическая реконструкция Антропоэстетика Арабы Арменоиды Армия Руси Археология Аудио Аутосомы Африканцы Бактерии Балканы Венгрия Вера Видео Вирусы Вьетнам Гаплогруппы генетика Генетика человека Генетические классификации Геногеография Германцы Гормоны Графики Греция Группы крови Деградация Демография в России Дерматоглифика Динарская раса ДНК Дравиды Древние цивилизации Европа Европейская антропология Европейский генофонд ЖЗЛ Живопись Животные Звёзды кино Здоровье Знаменитости Зодчество Иберия Индия Индоарийцы интеллект Интеръер Иран Ирландия Испания Исскуство История Италия Кавказ Канада Карты Кельты Китай Корея Криминал Культура Руси Латинская Америка Летописание Лингвистика Миграция Мимикрия Мифология Модели Монголоидная раса Монголы Мт-ДНК Музыка для души Мутация Народные обычаи и традиции Народонаселение Народы России научные открытия Наши Города неандерталeц Негроидная раса Немцы Нордиды Одежда на Руси Ориентальная раса Основы Антропологии Основы ДНК-генеалогии и популяционной генетики Остбалты Переднеазиатская раса Пигментация Политика Польша Понтиды Прибалтика Природа Происхождение человека Психология Разное РАСОЛОГИЯ РНК Русская Антропология Русская антропоэстетика Русская генетика Русские поэты и писатели Русский генофонд Русь Семиты Скандинавы Скифы и Сарматы Славяне Славянская генетика Среднеазиаты Средниземноморская раса Схемы США Тохары Тураниды Туризм Тюрки Тюрская антропогенетика Укрология Уралоидный тип Филиппины Фильм Финляндия Фото Франция Храмы Хромосомы Художники России Цыгане Чехия Чухонцы Шотландия Эстетика Этнография Этнопсихология Юмор Япония C Cеквенирование E E1b1b G I I1 I2 J J1 J2 N N1c Q R1a R1b Y-ДНК

Поиск по этому блогу

четверг, 5 февраля 2015 г.

Haplogroup HV (mtDNA)



From Wikipedia, the free encyclopedia
Haplogroup HV
Possible time of origin25000-30000 YBP[citation needed]
Possible place of originNear East or Caucasus[1]
AncestorR0
DescendantsHV0, HV1, HV2, HV3, HV4, HV5, H
Defining mutationsT14766C[2]
In human mitochondrial genetics,Haplogroup HV is a human mitochondrial DNA (mtDNA) haplogroup.

Origin

Haplogroup HV derives from the Haplogroup R0 (which in turn derives from haplogroup R). HV is also the ancestral haplogroup to Haplogroup H and Haplogroup V.

Distribution

Haplogroup HV is a west Eurasian haplogroup found throughout western Asia and southernand eastern Europe, especially Iran, Anatolia (present-day Turkey) and the Caucasus Mountains of southern Russia and the republic of Georgia.[citation needed] It is also found to a much lesser extent in parts of north-east Africa, mainly in the population of Sudanese Arabs, where the frequency of Eurasian ancestry is 22.5%,[3] and a very high frequency of Y-chromosome Haplogroup J (Y-DNA) is also found.[4]
A 2003 study was published reporting on the mtDNA sequencing of the bones of two 24,000-year-old anatomically modern humans of the Cro-Magnon type from southern Italy. The study showed one was of either haplogroup HV or R0.[5]

Subclades

Tree

This phylogenetic tree of haplogroup HV subclades is based on the paper by van Oven 2009[2] and Malyarchuk et al. 2008.[1]
  • HV
    • HV0 (formerly known as pre-V)
      • HV0a (formerly known as preV*2)
        • HV0a1
        • V
      • 195 (formerly known as preV*1)
        • HV0b
        • HV0c
    • HV1
      • HV1a
        • HV1a1
          • HV1a1a
        • HV1a2
      • HV1b
        • HV1b1
        • HV1b2
      • HV1c
    • 73
      • HV2
        • HV2a
    • HV4
      • HV4a
    • HV5
    • 16311 (formerly known as HV3) [6]
      • HV6 (formerly known as HV3b)
        • HV6a (formerly known as HV3b1)
      • HV7 (formerly known as HV3c)
      • HV8 (formerly known as HV3d)
      • HV9 (formerly known as HV3a)
        • 152
          • HV9a
      • HV10
    • H

HV0 and HVSI C16298T

Defining mutation C/T at location 16298 in segment I one of the hypervariable segment is labeled as HV0 as of 2012. The percentage of people that tested positive for the above mutation in a study of western European populations in 2002 is given below.[7]
Population#No % of population
Finland5012
Norway3234
Scotland8744
England2623
North Germany1406
South Germany2665
France2133
Galicia1355
North Portugal1847
Central Portugal1623
South Portugal1964
North Africa3495
In a study of Russian and Polish populations the percentage of people who tested positive for this mutation was five percent for both populations.[8]
Population#NoPercentage
Polish4365
Russian2015
A study of Iraqis summarized a number of previous studies showing low levels of this mutation amongst Middle Eastern populations.[9]
Population#No % of population
Iraqi2160.5
Syrian692.9
Georgian1390.7
Italian995.1
This mutation has been detected in ancient DNA obtained from one of nineteen human remains excavated on the island of Gotland, Sweden, dated to 2,800-2,000 BC and archaeologically classified as belonging to the Pitted Ware culture.[10]

See also

Mitochondrial Eve (L)
L0L1–6
L1L2L3L4L5L6
MN
CZDEGQASRIWXY
CZBFR0pre-JTP U
HVJTK
HVJT

References

  1. ^ Jump up to:a b Malyarchuk, B.; Grzybowski, T.; Derenko, M.; Perkova, M.; Vanecek, T.; Lazur, J.; Gomolcak, P.; Tsybovsky, I. (2008). "Mitochondrial DNA Phylogeny in Eastern and Western Slavs". Molecular Biology and Evolution 25 (8): 1651–8. doi:10.1093/molbev/msn114.PMID 18477584.
  2. ^ Jump up to:a b Van Oven, Mannis; Kayser, Manfred (2009). "Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation". Human Mutation 30 (2): E386–94.doi:10.1002/humu.20921. PMID 18853457.
  3. Jump up^ Afonso, C.; Alshamali, F.; Pereira, J.B.; Fernandes, V.; Costa, M.; Pereira, L. (2008). "MtDNA diversity in Sudan (East Africa)". Forensic Science International: Genetics Supplement Series 1: 257. doi:10.1016/j.fsigss.2007.10.118.
  4. Jump up^ Hassan, Hisham Y.; Underhill, Peter A.; Cavalli-Sforza, Luca L.; Ibrahim, Muntaser E. (2008). "Y-chromosome variation among Sudanese: Restricted gene flow, concordance with language, geography, and history". American Journal of Physical Anthropology 137 (3): 316–23.doi:10.1002/ajpa.20876. PMID 18618658.
  5. Jump up^ Caramelli, D; Lalueza-Fox, C; Vernesi, C; Lari, M; Casoli, A; Mallegni, F; Chiarelli, B; Dupanloup, I et al. (2003). "Evidence for a genetic discontinuity between Neandertals and 24,000-year-old anatomically modern Europeans". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 100 (11): 6593–7.Bibcode:2003PNAS..100.6593C. doi:10.1073/pnas.1130343100. PMC 164492.PMID 12743370.
  6. Jump up^ Haplogroup HV Ian Logan's Mitochondrial DNA Site 2009
  7. Jump up^ González, AM; Brehm, A; Pérez, JA; Maca-Meyer, N; Flores, C; Cabrera, VM (2003). "Mitochondrial DNA affinities at the Atlantic fringe of Europe". American Journal of Physical Anthropology 120 (4): 391–404. doi:10.1002/ajpa.10168. PMID 12627534.
  8. Jump up^ Malyarchuk, BA; Grzybowski, T; Derenko, MV; Czarny, J; Woźniak, M; Miścicka-Sliwka, D (2002). "Mitochondrial DNA variability in Poles and Russians". Annals of Human Genetics 66(Pt 4): 261–83. doi:10.1017/S0003480002001161 (inactive 2015-01-13). PMID 12418968.
  9. Jump up^ Al-Zahery, N; Semino, O; Benuzzi, G; Magri, C; Passarino, G; Torroni, A; Santachiara-Benerecetti, AS (2003). "Y-chromosome and mtDNA polymorphisms in Iraq, a crossroad of the early human dispersal and of post-Neolithic migrations". Molecular Phylogenetics & Evolution28 (3): 458–72. doi:10.1016/S1055-7903(03)00039-3. PMID 12927131.
  10. Jump up^ Malmström, Helena; Gilbert, M. Thomas P.; Thomas, Mark G.; Brandström, Mikael; Storå, Jan; Molnar, Petra; Andersen, Pernille K.; Bendixen, Christian et al. (2009). "Ancient DNA Reveals Lack of Continuity between Neolithic Hunter-Gatherers and Contemporary Scandinavians". Current Biology 19 (20): 1758–62. doi:10.1016/j.cub.2009.09.017.PMID 19781941.

External links


Автор: varent на 07:51
Ярлыки: , , ,