Темы

C Cеквенирование E E1b1b G I I1 I2 J J1 J2 N N1c Q R1a R1b Y-ДНК Австролоиды Альпийский тип Америнды Англия Антропологическая реконструкция Антропоэстетика Арабы Арменоиды Армия Руси Археология Аудио Аутосомы Африканцы Бактерии Балканы Венгрия Вера Видео Вирусы Вьетнам Гаплогруппы Генетика человека Генетические классификации Геногеография Германцы Гормоны Графики Греция Группы крови ДНК Деградация Демография в России Дерматоглифика Динарская раса Дравиды Древние цивилизации Европа Европейская антропология Европейский генофонд ЖЗЛ Живопись Животные Звёзды кино Здоровье Знаменитости Зодчество Иберия Индия Индоарийцы Интеръер Иран Ирландия Испания Исскуство История Италия Кавказ Канада Карты Кельты Китай Корея Криминал Культура Руси Латинская Америка Летописание Лингвистика Миграция Мимикрия Мифология Модели Монголоидная раса Монголы Мт-ДНК Музыка для души Мутация Народные обычаи и традиции Народонаселение Народы России Наши Города Негроидная раса Немцы Нордиды Одежда на Руси Ориентальная раса Основы Антропологии Основы ДНК-генеалогии и популяционной генетики Остбалты Переднеазиатская раса Пигментация Политика Польша Понтиды Прибалтика Природа Происхождение человека Психология РАСОЛОГИЯ РНК Разное Русская Антропология Русская антропоэстетика Русская генетика Русские поэты и писатели Русский генофонд Русь США Семиты Скандинавы Скифы и Сарматы Славяне Славянская генетика Среднеазиаты Средниземноморская раса Схемы Тохары Тураниды Туризм Тюрки Тюрская антропогенетика Укрология Уралоидный тип Филиппины Фильм Финляндия Фото Франция Храмы Хромосомы Художники России Цыгане Чехия Чухонцы Шотландия Эстетика Этнография Этнопсихология Юмор Япония генетика интеллект научные открытия неандерталeц

Поиск по этому блогу

воскресенье, 8 февраля 2015 г.

Гаплогруппа K(xLT) (Y-ДНК)

Материал из Википедии — свободной энциклопедии

Гаплогруппа K(xLT) - MNOPS
Происхождение гаплогруппы K(xLT) - MNOPS
Происхождение гаплогруппы K(xLT) - MNOPS
Типмакрогруппа Y-ДНК
Время появления55–47 тыс.л.н.
Место появленияюжная или центральная Азия
Предковая группамакрогруппа K
Сестринские группымакрогруппа LT (предок L и T)
СубкладыK1, K2, K3, M и S, макрогруппы NO и P
Мутации-маркерыM526/PF5979 (изначально rs2033003)
В популяционной генетике и геногеографии человека, изучающих Y-хромосомные гаплогруппы,гаплогруппа K(xLT) (или K-M526) —патрилинейная наследственность, характеризуемая Y-хромосомной ДНК-мутацией M526/PF5979[1]. Поскольку от неё происходит целый ряд других гаплогрупп, является макрогруппой. Произошла от макрогруппы K 55-47 тысячелетий назад в южной или центральной Азии — то есть в скором времени после заселения этого региона.
В ранних версиях древа Y-ДНК отсутствовала (в макрогруппе K, наряду с малыми субкладами, напрямую выделялись ветви L, M, NO и P, в 2008 году к ним добавились S и T). Впоследствии в группах NO и P была открыта общая мутация rs2033003, и в 2009 году эти гаплогруппы стали рассматриваться как ветви макрогруппы NOP. Однако уже в 2010 году выяснилось, что эта же метка (получившая имя M526) присутствует и в группах M и S, так что была сформирована макрогруппа MNOPS. Далее, в 2011 году были обнаружены мутации, роднящие гаплогруппы L и T, а M526 была обнаружена и у малых субклад K1, K2, K3 и K4, так что на дереве гаплогрупп появилась группа LT, а группу MNOPS переименовали в K(xLT), поскольку теперь под макрогруппой K осталось лишь две ветви: «LT» и «не-LT».
Это «революционное» решение ИХК (англ. Y-Chromosome Consortium (YCC)) породило ряд споров, потому что, во-первых, возникла путаница: группы K1, K2, K3, K4 стали относиться не напрямую к K, но вместо этого к её субкладе K(xLT), во-вторых, формулировка вида «K(xLT)» традиционно означала «всё, относящееся к K, кроме относящегося к LT» (или, короче — «K вне LT»), и теперь нет очевидного способа различать между старым и новым употреблением. Разница в их значениях в данном конкретном случае не велика, но вполне определённа, а именно: «K(xLT)» в традиционном смысле включало бы также парагруппу K* и возможно открытые бы в будущем ветви K, не имеющие метки M526, но не относящиеся и к LT.
Традиционным решением в такой ситуации могло бы быть:
  1. переименовать гаплогруппы K1, K2, K3 и K4 в U, V, W и X, а макрогруппу MNOPS в MNOPSUVWX;
  2. переименовать K1, K2, K3 и K4 в K(xLT)1, K(xLT)2, K(xLT)3 и K(xLT)4;
  3. переименовать LT в K1, MNOPS в K2, а K1, K2, K3 и K4 в K2a, K2b, K2c и K2d, в этом случае M, NO, P и S оказываются подмножествами ветви K2;
однако Консорциум не счёл эти варианты удовлетворительными и постановил в порядке исключения допустить иерархическую несогласованность в обозначении ветвей K и K(xLT).
В 2012 году подветвь K1 была язъята из дерева, так как была признана недостаточно древней, а K2, K3 и K4 переименованы в K1, K2 и K3 соответственно.
Y-хромосомная гаплогруппа K(xLT) была обнаружена у палеосибиряка из Усть-Ишима(45 тыс. лет)[2].

Древо

Общая структура следующая:
   Макрогруппа K(xLT)   

[K1]




[K3] (зафиксирована у балийцев[4])



Макро-группа NO





Макро-группа P


Макро-группа R
Макро-группа R1













Древо именованных субклад макрогруппы K(xLT) и определяющие их мутации на начало 2013 года выглядят следующим образом[5] (нисходящие ветви гаплогрупп опущены):
K(xLT) (M526/PF5979)
  • K(xLT)* -
  • K1 (P60, P304, P308)
  • K2 (P79, P299, P307)
  • K3 (P261, P263)
  • M (P256, Page93)
  • NO (M214/Page39, P188, P192, P193, P194, P195)
    • NO* -
    • N (M231/Page91, Page56/S323)
    • O (M175, P186, P191, P196)
  • P (92R7_1, 92R7_2, L138, L268, L405, L471/PF5989, L536/PF5860, L721/PF6020, L741, L768/PF5976/YSC0000274, L779/PF5907/YSC0000251, L781/PF5875/YSC0000255, M45/PF5962, M74/N12, P27.1_1/P207, P27.1_2, P69, P226/PF5879, P228/PF5927, P230/PF5925, P235/PF5946, P237/PF5873, P239, P240/PF5897, P243/PF5874, P244, P281/PF5941, P282/PF5932, P283/PF5966, P284, P295/PF5866/S8, Page83)
    • Q (M242)
    • R (M207/Page37/UTY2, P224, P227, P229, P232, P280, P285, S4, S9)
  • S (M230,P202, P204)

Эволюционное древо гаплогрупп Y-хромосомы человека
Y-хромосомный Адам
A00A0-T
A0A1
A1aA1b
A1b1BT
BCT
DECF
DECF
GHIJK
GHIJK
HIJK
IJK
IJLT
LTNO
NOP
SMQR

Источники

  1.  Jacques Chiaroni, Peter A. Underhill, and Luca L. Cavalli-Sforza, "Y chromosome diversity, human expansion, drift, and cultural evolution, " PNAS published online before print November 17, 2009, doi: 10.1073/pnas.0910803106
  2.  Supplementary information 9. Philogenetic reconstruction of the Ust’Ishim Y-chromosome
  3.  Manfred Kayser, Ying Choi, Mannis van Oven et al., "The impact of the Austronesian expansion: evidence from mtDNA and Y-chromosome diversity in the Admiralty Islands of Melanesia," Molecular Biology and Evolution (2008)
  4.  Tatiana M. Karafet, Brian Hallmark, Murray P. Cox et al., "Major East-West Division Underlies Y Chromosome Stratification Across Indonesia," MBE Advance Access published March 5, 2010
  5.  Y-DNA Haplogroup K and its Subclades - 2013 (англ.). International Society of Genetic Genealogy (последнее обновление: 4 января 2013). Проверено 7 января 2013. Архивировано из первоисточника 11 января 2013.