Максимум частоты U3 приходится на Ближний Восток и Кавказ: у большинства популяций региона доля U3 варьирует в пределах 2%-7%, иногда достигая более высоких значений, как например у иорданцев Аммана (15%) или берберов-мозабитов Северной Африки (10%), в последнем случае по причине дрейфа. Также отметим предельно высокую частоту (от 15% до 30%) в большинстве популяций европейских цыган, при очень низком разнообразии. На Балканах средняя частота держится в пределах 2%-3%, опускаясь до 1.5% в центре Европы и еще более снижаясь в западном и восточном направлении ниже 1%, за исключением украинской популяции, где засвидетельствовано значение 2.3%.
В целом U3 имеет ярко выраженный "неолитический" характер распределения частот, убывающих по мере удаления от Ближнего Востока. У русских частота U3 составляет немногим менее 1%.
Результаты исследований палеоДНК:В целом U3 имеет ярко выраженный "неолитический" характер распределения частот, убывающих по мере удаления от Ближнего Востока. У русских частота U3 составляет немногим менее 1%.
| Гаплогруппа | Возраст | N | Арх. культура, регион | Источник |
| U3 | 3,500-3,000 до н.э. | 1 | Vaihingen an der Enz (LBK), Германия | Bramanti et al. (2009) |
| U3 | 5360±40 лет назад | 1 | CAVES OF WADI EL-MAKKUKH (WM27), Израиль | Salamon et al. (2010) |
| U3 | 10-11 в. | 1 | Регион Карпат, Венгрия | Nagy et al. (2011) |
| U3 | 12-13 в. | 2 | Apollo Klarios (Византия) | Ottoni et al. (2011) |
| U3a2 | 12-13 в. | 1 | Lower Agora (Византия) | Ottoni et al. (2011)http://gentis.ru/info/mtdna-tutorial/hg-u/u3 |
