Темы

Австролоиды Альпийский тип Америнды Англия Антропологическая реконструкция Антропоэстетика Арабы Арменоиды Армия Руси Археология Аудио Аутосомы Африканцы Бактерии Балканы Венгрия Вера Видео Вирусы Вьетнам Гаплогруппы генетика Генетика человека Генетические классификации Геногеография Германцы Гормоны Графики Греция Группы крови Деградация Демография в России Дерматоглифика Динарская раса ДНК Дравиды Древние цивилизации Европа Европейская антропология Европейский генофонд ЖЗЛ Живопись Животные Звёзды кино Здоровье Знаменитости Зодчество Иберия Индия Индоарийцы интеллект Интеръер Иран Ирландия Испания Исскуство История Италия Кавказ Канада Карты Кельты Китай Корея Криминал Культура Руси Латинская Америка Летописание Лингвистика Миграция Мимикрия Мифология Модели Монголоидная раса Монголы Мт-ДНК Музыка для души Мутация Народные обычаи и традиции Народонаселение Народы России научные открытия Наши Города неандерталeц Негроидная раса Немцы Нордиды Одежда на Руси Ориентальная раса Основы Антропологии Основы ДНК-генеалогии и популяционной генетики Остбалты Переднеазиатская раса Пигментация Политика Польша Понтиды Прибалтика Природа Происхождение человека Психология Разное РАСОЛОГИЯ РНК Русская Антропология Русская антропоэстетика Русская генетика Русские поэты и писатели Русский генофонд Русь Семиты Скандинавы Скифы и Сарматы Славяне Славянская генетика Среднеазиаты Средниземноморская раса Схемы США Тохары Тураниды Туризм Тюрки Тюрская антропогенетика Укрология Уралоидный тип Филиппины Фильм Финляндия Фото Франция Храмы Хромосомы Художники России Цыгане Чехия Чухонцы Шотландия Эстетика Этнография Этнопсихология Юмор Япония C Cеквенирование E E1b1b G I I1 I2 J J1 J2 N N1c Q R1a R1b Y-ДНК

Поиск по этому блогу

понедельник, 16 февраля 2015 г.

Гаплотипы «африканской» гаплогруппы А


А.А. Клёсов 

По состоянию на конец июля 2009 года база данных YSearch содержала 137 25-маркерных гаплотипов гаплогруппы А, и 107 из них были 37- маркерными. Это дает возможность попытаться рассчитать, когда жили общие предки данной выборки.

При этом надо, конечно, понимать, что эта выборка не представляет в полной мере население Африки, имеющее гаплогруппу А. Поскольку это коммерческая база данных, то приведенные там представители гаплогруппы - достаточно обеспеченные люди. В их составе вряд ли есть представители африканских джунглей.

Первый сюрприз в данном исследовании начался с рассмотрения состава данной выборки по странам. Из 137 человек эти данные сообщили в базе данных 96 человек, причем не о себе, а об их наиболее удаленных известных предках. Состав следующий:




Не считая Алжира, об африканских предках в базе данных вообще сведений нет.


Вот как сообщает о гаплогруппе А сводка Международного Общества Генетической Генеалогии (ISOGG) за 2009 год:

Гаплогруппа А представляет старейшую ветвь на Y-хромосомном дереве человечества, которая, видимо, ведет начало с 60000 лет назад. Подобно гаплогруппе В, линия А наблюдается только в Африке, и встречается по всему континенту. Она чаще всего встречается в Эфиопии и Судане, и среди популяций, говорящих на щелкающих языках. Фрагментарное распределение этой
гаплогруппы может свидетельствовать о том, что это - остатки древних ДНК- линий. Наиболее распространенными субкладами гаплогруппы А являются А2, А3b1, и  А3b2. Последняя встречается у 1.1% афро-американцев.

Дополняющие сведения предоставляет работа (King et al, 2007). Они дают сводку данных о появлении африканцев в северо-западной Европе, сообщают, что гаплогруппа А является древнейшей в филогении хромосомы Y (но количественных сведений не представляют), что она относится именно к Африке, и что из тестированных 3351 африканцев гаплогруппа А была обнаружена у 5.4%. Авторы не комментируют эту цифру, но заметим, что это немного, и, видимо, остальные имели гаплогруппы В, Е (48% в Африке по данным той же статьи принадлежат только одному субкладу E3a), и сводную гаплогруппу CF, которой много на африканском континенте. В то же время, по данным авторов, вне пределов Африки гаплогруппу А имели всего семь человек, не относящих себя к африканцам (Турция, Кипр, Сардиния и Оман). Далее, субклад А1 был обнаружен в Мали только у одного человека из тестированных 44. А всего этот субклад был найден еще у 25 человек из более тысячи тестированных - 2/64 марокканских берберов, 3/766 афро-американцев, 2/39 в Сенегале, 1/201 на острове Cape Verde, 14/276 в Гвинее-Биссау, и 2/39 из Нигера.

От себя добавим, что сейчас, в середине августа 2009, через два года после публикации статьи Кинга, база данных YSearch насчитывает всего 12 человек в разделе гаплогруппы А1 - из США (4), Англии (2), Ирландии (2), Германии (1), и трое не дали сведений. Никто не упомянул африканское происхождение.

Возращаемся к гаплогруппа А. Дерево 37-маркерных гаплотипов приведено на рис. 1.


Видно, что дерево состоит из двух основных ветвей - «старой» (в нижней части дерева) и относительно «молодой» в отношении времен жизни их общих предков. «Молодая» ветвь состоит из 69 гаплотипов, и в ней содержится 440 мутаций от базового 25-маркерного гаплотипа (приведен 37-маркерный гаплотип)

13 24 14 11 11 14 12 12 12 13 13 29 - 17 9 10 11 11 25 15 19 29 15 15 17 17 - 11 11 19 23 16 15 18 17 36 38 12 12

Это дает время жизни общего предка ветви 4050±450 лет назад.

Базовый 25-маркерный гаплотип нижней ветви из 38 гаплотипов

13 22 14 10 13(14) 15 11 14 12 13 11 29 - 16 8 9 9 11 23 15 20 30 12 14 15 16

на 27.5 мутаций на 25 маркерах отличается от «молодого» базового гаплотипа. Все 38 гаплотипов содержат 812 мутаций, что дает 20650±2200 лет до общего предка ветви. По разнице в мутациях между базовыми гаплотипами двух основных ветвей можно рассчитать возраст ИХ общего предка. Он жил примерно 28200 лет назад.

Это намного меньше, чем обычно предполагается для общего предка гаплогруппы А. Или рассмотренная в данном исследовании серия гаплотипов не является представительной для гаплогруппы, или гаплогруппа не столько древняя, как представляется. Возможно и то, и другое. Будущие исследования скорректируют наши представления.

Литература

King, T.E., Parkin, E.J., Swinfield, G., Cruciani, F., Scozzari, R., Rosa, A., Lim, S.- K., Xue, Y., Tyler-Smith, C., Jobling, M. (2007) Africans in Yorkshire? The deepest-rooting clade of the Y phylogeny within an English genealogy. Eur. J. Human Genetics, 15, 288-293.