Гаплогруппа R2 какая-то неудобная. Неудобная и незаметная. Находится где-то на «периферии мира», на юге Азии, в основном в Индии, но и немного на Кавказе, и среди цыган - это определенно из Индии (может, и на Кавказе - от цыган?), еще среди небольшой молодой группы евреев, с общими предками 650 и 175 лет назад (Klyosov, 2008). К ним мы еще вернемся. Вполне возможно, что от тех же цыган.
Вот что пишет об этой гаплогруппе Спенсер Уэллс (Wells, 2006): «Примерно 25 тысяч лет назад некий мужчина в южной части Средней Азии приобрел генетический маркер М124. Его потомки мигрировали туда, где сейчас расположен Пакистан, и восточнее - в Индию. Сейчас там 5-10% носителей гаплогруппы R2».
В 2006 году Сенгупта (Sengupta et al, 2006) опубликовал список из 1089 десятимаркерных гаплотипов, со следующим распределением по странам и территориям:
Индия 728 гаплотипов, из них 68 R2 (9.3%) и два R*
Пакистан 177 гаплотипов, из них 13 R2 (7.3%) и семь R* (4%)
По остальным странам и териториям гаплогруппы R2 на было. Были такие:
Камбоджа 6 гаплотипов , в основном О, по одному N и Н Китай 128 гаплотипов, много разных гаплогрупп, из них 11 гаплотипов R1b (8.6%), один случайный J2, R1a1 не было. Япония 23 гаплотипа, почти все О и D Cибирь 18 гаплотипов, почти все N1c (и два С3а2)
Средняя Азия 9 гаплотипов, все R1a1.
Таким образом, гаплогруппа R2 действительно сосредоточена - по приведенным странам и территориям - только в Индии и Пакистане. При этом маловероятно, чтобы ей было 25 тысяч лет, как пишет Уэллс, но цену его датировкам мы уже знаем.
Проведем определение времен жизни общего предка (или предков) этой гаплогруппы в Индии и Пакистане. Всего рассмотрим 90 гаплотипов, из них девять гаплотипов группы R*. Посмотрим, куда они устроятся на дереве.
Дерево приведено на рис. 1.
Видно, что отдельная ветвь в правой нижней части дерева целиком состоит из гаплотипов R* пакистанского происхождения, с одним индийским. Два других R*, индийский и пакистанский, сидят на соседней ветви. Это - издержки относительно коротких гаплотипов, дерево их разделяет с трудом.
Рассмотрим все четыре основные ветви - одна ветвь слева, одна справа вверху, одна внизу, и ветвь R* справа внизу. Средняя скорость мутаций в таком 10-маркерном гаплотипе 0.0018 мутаций на маркер на поколение (в 25 лет) (Klyosov, 2009).
9 гаплотипов гаплогруппы R* имеют всего 22 мутации, что дает 3950±930 лет до общего предка. Это, конечно, результат прохождения относительно недавнего бутылочного горлышка популяции R* в юго-восточной Азии, или слишком локальной территорией сбора гаплотипов. Смотрим на карту. Носители гаплогруппы R* из списка живут на востоке и юге Индии, на севере и юге Пакистана. География довольно обширная, хотя и ограничена. Значит, дрейф гаплотипов, бутылочное горлышко. Базовый гаплотип в формате FTDNA (последний маркер здесь записан не суммарно с DYS389-1, а индивидуально DYS389-2):
13- 23-14-10-X-X-X-12-11-14-12-16 (DYSA 7.2 = 10)
Ветвь справа внизу, принадлежащая гаплогруппе R2, состоит из двух подветвей. Одна - из семи гаплотипов (гаплотипы R* снимаются), все содержат всего 15 мутаций, что дает 3375±930 лет до общего предка. Базовый гаплотип этой ветви
13- 23-15-10-X-X-X-12-11-14-10-16 (DYSA 7.2 = 9)
Вторая половина ветви, из 8 гаплотипов, содержит всего 9 мутаций от базового гаплотипа
14- 23-15-10-X-X-X-12-11-14-10-16 (DYSA 7.2 = 10)
Это дает 1675±580 лет до общего предка. Это вообще в районе 4-го века нашей эры. Между этими двумя полуветвями всего 1.72 мутации, что разделяет из общих предков на 2650 лет, и помещает ИХ общего предка примерно на 3850 лет назад, то есть общий предок первой полуветви, с возрастом 3375±930 лет, и есть общий предок для всей ветви.
Верхняя правая ветвь из 22 гаплотипов имеет 55 мутаций от базового гаплотипа
14- 23-14-10-X-X-X-12-11-13-10-16 (DYSA 7.2 = 10)
что дает 4050±680 лет до общего предка. Между двумя ветвями гаплогруппы R2 на правой стороне дерева 4 мутации, что разносит общих предков на 7100 лет, и помещает ИХ общего предка примерно на 7300 лет назад.
Наконец, левая ветвь из 44 гаплотипов имеет 106 мутаций от базового гаплотипа
12- 23-14-10-X-X-X-12-10-13-10-16 (DYSA 7.2 = 10)
Это явно дочерняя ветвь предыдущей, так как отличается от нее всего на 0. 79 мутации. Ее возраст - 3875±540 лет, и одна мутация между ними помещает ИХ общего предка примерно на 4500 лет назад.
Таким образом, общий предок гаплогруппы R2 в Индии и Пакистане, представленный выборкой из 81 гаплотипа, жил примерно 7300 лет назад. Не исключено, что это и есть возраст гаплогруппы R2, судя по ее концентрации на довольно ограниченной территории.
Что касается гаплогруппы R2 у евреев, то вот как выглядит 12-маркерное дерево соответствующих гаплотипов (рис. 2). Видно, что это две разных ветви, разного возраста. Анализ этих гаплотипов показал (Klyosov, 2008), что их базовые гаплотипы на первых 12 маркерах следующие:
14-23-14-10-13-20-12-12-11-14-10-15
14-23-14-10-13-20-12-12-10-13-10-18
Видно, что гаплотипы евреев гаплогруппы R2 очень похожи на индийские гаплотипы, отличаясь только на две мутации от базового гаплотипа с общим предком 1675±580
14-23-15-10-X-X-X-12-11-14-10-16
Верхний гаплотип евреев принадлежал общему предку, который жил 650±230 лет назад, нижний - 175±125 лет назад. Но пять мутаций между их предковыми гаплотипами разносят их общих предков на 7350 лет, и определяют ИХ общего предка гаплогруппы R2 примерно на 4100 лет назад. Это, как мы только что видели, обычные времена предков гаплогруппы R2. Таким образом, было по меньшей мере два проникновения (вероятно, цыган) в среду евреев, отсюда и две разных генеалогических ветви, сводящихся к древним временам индийской гаплогруппы R2.
Литература
Klyosov, A.A. Origin of the Jews (2008) Proceedings of the Russian Academy of DNA Genealogy. 1, №1, 54-232.
Klyosov, A.A. (2009) DNA Genealogy, Mutation Rates, and Some Historical Evidences Written in Y-Chromosome. I. Basic Principles and the Method. J. Genet. Geneal., in the press.
Sengupta, S., Zhivotovsky, L.A., King, R., Mehdi, S.Q., Edmonds, C.A., Chow, C.- E. T., Lin, A.A., Mitra, M., Sil, S.K., Ramesh, A., et al. (2006). Polarity and temporality of high-resolution Y-chromosome distributions in India identify both indigenous and exogenous expansions and reveal minor genetic influence of Central Asian Pastoralis. Amer. J. Human Genet. 78, 202-221. Wells, S. Deep Ancestry. Inside the Genographic Project (2006) National Geographic, Washington, DC, 248 p.