Темы

Австролоиды Альпийский тип Америнды Англия Антропологическая реконструкция Антропоэстетика Арабы Арменоиды Армия Руси Археология Аудио Аутосомы Африканцы Бактерии Балканы Венгрия Вера Видео Вирусы Вьетнам Гаплогруппы генетика Генетика человека Генетические классификации Геногеография Германцы Гормоны Графики Греция Группы крови Деградация Демография в России Дерматоглифика Динарская раса ДНК Дравиды Древние цивилизации Европа Европейская антропология Европейский генофонд ЖЗЛ Живопись Животные Звёзды кино Здоровье Знаменитости Зодчество Иберия Индия Индоарийцы интеллект Интеръер Иран Ирландия Испания Исскуство История Италия Кавказ Канада Карты Кельты Китай Корея Криминал Культура Руси Латинская Америка Летописание Лингвистика Миграция Мимикрия Мифология Модели Монголоидная раса Монголы Мт-ДНК Музыка для души Мутация Народные обычаи и традиции Народонаселение Народы России научные открытия Наши Города неандерталeц Негроидная раса Немцы Нордиды Одежда на Руси Ориентальная раса Основы Антропологии Основы ДНК-генеалогии и популяционной генетики Остбалты Переднеазиатская раса Пигментация Политика Польша Понтиды Прибалтика Природа Происхождение человека Психология Разное РАСОЛОГИЯ РНК Русская Антропология Русская антропоэстетика Русская генетика Русские поэты и писатели Русский генофонд Русь Семиты Скандинавы Скифы и Сарматы Славяне Славянская генетика Среднеазиаты Средниземноморская раса Схемы США Тохары Тураниды Туризм Тюрки Тюрская антропогенетика Укрология Уралоидный тип Филиппины Фильм Финляндия Фото Франция Храмы Хромосомы Художники России Цыгане Чехия Чухонцы Шотландия Эстетика Этнография Этнопсихология Юмор Япония C Cеквенирование E E1b1b G I I1 I2 J J1 J2 N N1c Q R1a R1b Y-ДНК

Поиск по этому блогу

четверг, 30 декабря 2010 г.

Объединение в кластеры европейских Y-STR

Объединение в кластеры европейских  STR маркеров Y-хромосом (это называется «Коротким Тандемным Повтором» (англ. Short Tandem Repeat).
Roewer и др. , ранее обнаружил упорядоченную структуру в европейских Y-хромосомах с Y-STR повторах (процесс теста специальных ДНК-маркеров ). Новое исследование, пять лет спустя, использует огромную базу данных образцов  населения. В то время как Y-SNP, определяющие гаплогруппы, более безопасны из-за предотвращения homoplasy, которая может быть проблемой с несколькими маркерами Y-STR, я полагаю, что большинство главных  гаплогрупп можно отличить даже с немногими Y-STR маркерами, таким образом задокументированные результаты действительны.

 Из обработанного материала:
 В общей сложности 33 010 мужчин мы выявили 4 176 различных гаплотипов, 2 192 были уникальными, и 56 соответствует 42% от хромосомы Y.
 Интересно, что такая малая доля гаплотипов соответствует почти половине Y хромосом. 7 Y-STR обычно не достаточно для определения монофилетических линий (как на перераспределение людей гаплотипа Коэна  хорошо известно в настоящее время).  Было бы интересно посмотреть, что эта доля, как ожидается, будет по предположению репродуктивного равенства, для оценки силы социального выбора, что я предположил, может быть  мега-гаплогруппы мы наблюдаем в мире сегодня.
Вот синтетическая карта Европы, показывающая распределение различных групп:
 
(a) Пространственное распределение самого частого Y-STR  маркера групп гаплотипов в Европе и в соседних областях.
 (b) Пространственное распределение Y-STR гаплотипов -составляющие группы - вторая частота в Западной Европе.



Теперь, смотрите на карту предсказанного языкового распределения финским ученым Кэлеви Вииком для 5 500 годов до н.э:
 

Связь не очевидна, но это достаточно близко, чтобы заслужить последующее исследование. Небольшие различия могут быть приписаны 7 500 годам истории; например, в 5,500 до н.э. в Скандинавии не было вероятно никаких германо-говорящих народов.

Также интересно:

Две группы были определены на большие области Балканского полуострова: 1) Хорватия, Босния и Герцеговина, Сербия, Румыния, Западная и Восточная Венгрия, и Центральная Украина: кластер 18; (2) континентальная Греция, Болгария, и Македония: кластер 2. Кластер13 был назначен для Албании и на западную область Балкан - кластер 10 и кластер 11 для Кавказа.

Forensic Science International: Genetics doi:10.1016/j.fsigen.2010.09.010
(Международная научная медицина: Генетика doi:10.1016/j.fsigen.2010.09.010)

Геостатистические выводы главных групп Y-STR-гаплотипов в Европе;

Амалия Диаз - Лакава и др. 

Мы исследовали многообразную генетическую разнородность Европы и соседних областей в географической перспективе. Мы создали сложные карты, обрисовывающие в общих чертах предполагаемое географическое распределение главных групп генетически одноотипных людей на основе специальных ДНК-маркеров Y-хромосом. Мы проанализировали Y-хромосомные гаплотипы  составленных из 7  полиморфных мест STR, генотип для 33 010 образцов, собранных на 249 участках в Европе, Западной Азии и Северной Африке, заложенных в базе данных YHRD (www.yhrd.org). Набор данных включал 4176 различных гаплотипов, которые мы сгруппировали в 20 групп. Для каждой группы была вычислена частота за участок. Весь геостатический анализ был выполнен с географической  информационной системой  "GRASS-GIS.". Мы интерполировали ценности частоты через область исследования отдельно для каждой группы. Сочетая все 20 интерполированных поверхностей, мы указываем мудро показанные на экране для самых высоких частот группы и сохранили это параллельно с соответствующим лейблом группы. Мы объединили эти два типа данных в общей карте. Мы повторили эту процедуру для вторых самых высоких частот в Европе. Главные группы назначили на Северную, Западную и Восточную Европу. Северная Африка построила отдельную область, Юго-восточная Европа, Турция и Ближний Восток были разделены на несколько областей. Пространственное распределение групп, объясняющих вторые самые высокие частоты в Европе, наложилось на территориями наибольших стран. Генетическая структура, представленная в сложных картах, соответствует главным историческим геополитическим областям и в согласии с предыдущими исследованиями генетических частот, утверждая наш подход. Наш генетический геостатический подход обеспечивает, на основе двух сложных карт, детализированное свидетельство географического распределения и относительных частот большинства преобладающих групп существующего европейского населения мужского пола, исследованного на основе специальных Y-STR гаплотипов. Наличие значительных генетических различий среди географических подгрупп в Европе имеет важные последствия для статистических выводов  в полученные исследовательские-медицинские анализы гаплотипов Y-STR.
http://dienekes.blogspot.com/2010/11/clustering-of-european-y-strs.html
P.S.Видно  что  русские  находятся  в  одном  кластере  с Поляками, Белорусами, и Восточными немцами. (Бывшая  ГДР, ранее  Пруссия)