Расшифровка генома древнего человека

Антрополог Станислав Дробышевский о многомерном анализе ДНК, различиях между современными и древними людьми и замещении генов неандертальцев

ПостНаука и РВК реализовали проект, позволяющий журналистам ориентироваться в процессах современной науки. ПостНаука организовала лекции в редакциях ключевых для России медиа.

DM: Мумия сибирского мальчика раскроет секреты жизни древних племен

Ученые из России и Южной Кореи приступили к изучению останков найденной в гробнице возле современного Салехарда мумии средневекового мальчика. Как сообщает Daily Mail, ученые собираются восстановить картину жизни мальчика, узнать как можно больше о племени, в котором он жил.

Возможно, это выглядит как декорация для фильма ужасов, но именно эта древняя мумия может «рассказать», как жили племена на севере России сотни лет тому назад. Как утверждает корреспондент Daily Mail Уилл Стюарт, ученые приступили к изучению останков найденной в гробнице возле современного Салехарда мумии средневекового мальчика, который умер в возрасте 6-7 лет. 

Афонтова гора

Материал из Википедии — свободной энциклопедии

Находки со стоянок Афонтовой горы. Красноярский краеведческий музей.

Афонтова гора — группа из четырёх стоянок позднего палеолита у Красноярска, расположенная на левом берегу Енисея.

Содержание

• 1 История изучения стоянок Афонтовой горы
• 2 Международный культурно-образовательный центр «Афонтова гора»
• 3 См. также
• 4 Литература
• 5 Примечания
• 6 Ссылки

История изучения стоянок Афонтовой горы

Археологические исследования на Афонтовой горе начались в 1884 году И. Т. Савенковым. 3 августа 1884 года ему удалось найти изделие, форма которого могла свидетельствовать о палеолитическом возрасте памятника. Девять лет И. Т. Савенков наблюдал за разрезами по выработке кирпичной глины и зоной строительства железной дороги, на участке, впоследствии получившем название Афонтова гора I. Находки залегали на глубине от 1,2—1,5 до 1,7—1,9 метров. В 1892 году И. Т. Савенков представил результаты своих археологических исследований участникам II Международного антропологического конгресса в Москве. В 1880-е—1890-е годы Савенковым была собрана коллекция из полутора тысяч экземпляров фауны и двухсот пятидесяти «древних изделий».
Возможно, в это число входили и сборы с участков, названных позднее Афонтова гора III и IV и, возможно, II. В 1896 и 1899 годах на Афонтовой горе проводил сборы каменных орудий и ископаемых костей французский археолог, этнограф и путешественник Жозеф барон де Бай (1853—1931)^[1].
В первое десятилетие XX века местные исследователи неоднократно предпринимали очень ограниченные работы на Афонтовой горе как по своей инициативе, так и по поручению РГО. В 1910—1913 годы сборы палеонтологического материала со склонов Афонтовой горы в районе дачи и библиотеки Г. В. Юдина проводил В. И. Громов. Летом 1914 года раскопки у нефтяного склада проводит И. Т. Савенков. Им было заложено шесть раскопов общей площадью 169 м². После смерти И. Т. Савенкова подъемные сборы и небольшие раскопки предпринимались А. Я. Тугариновым в (1919 году, Афонтова 2, участок 5), Г. П. Сосновским в (1919 году, Афонтова гора 2, участки 1,3), Г. Мергартом в (1920 году, Афонтова гора 2, участок 5), а также В. И. Громовым, С. М. Сергеевым, Н. К. Ауэрбахом.
В 1923 году Н. К. Ауэрбаху и Г. П. Сосновскому удалось организовать раскопки Афонтовой горы II на участке 2 («основном»), где был зафиксирован выход культурного слоя большой мощности. Здесь был заложен раскоп площадью 38 м², вскрытый на глубину до тринадцати метров. Результатом этих работ стала коллекция, в составе которой только каменных и костяных изделий насчитывалось более двухсот пятидесяти единиц. Были найдены и пять фрагментов костей человека. В 1924 и 1925 годах на участке 2 было вскрыто 42 и 28 м². Раскопками руководят Н. К. Ауэрбах, В. И. Громов и, частично, Г. П. Сосновский. Только с участка 2 Афонтовой горы было получено около пятидесяти каменных орудий из верхнего культурного слоя, 450 каменных и 26 костяных орудий, двадцать тысяч отщепов, около двухсот пятидесяти пластин и микропластин, фаунистические остатки двадцати семи видов животных и кости человека.
В 1925 году Н. К. Ауэрбах и В. И. Громов предпринимают раскопки Афонтовой горы III, на площади нефтяного склада, у бывших усадеб акционерных обществ «Нобель» и «Волга». Была вскрыта площадь в 100 м² на участках 7-14. Найдено около девятисот каменных и 146 костяных орудий, две тысячи костей. В 1926—1929 годах раскопки стоянок сворачиваются, основное внимание уделяется безуспешным попыткам сохранить их от застройки и разрушения.
В 1937 году Афонтова гора стала одним из пунктов осмотра участниками сибирской экскурсии 17 Международного геологического конгресса. В разрезе Афонтовой горы II французским археологом Ш. Фромаже был найден фрагмент черепа человека, а китайским археологом Пей Вэнь-Чжуном — подвески из трубчатых костей птиц.
В 1970-е—1980-е годы район Николаевки был почти полностью застроен. Единственным местом, где была возможность организовать раскопки были южный и северо-восточный склоны горы у библиотеки им. Юдина (Афонтова гора II).
С 1992 года на стоянке Афонтова гора II проводились археологические исследования Е. В. Артемьевым. В результате исследований 1992—2006 годах получена представительная коллекция изделий из кости, рога и бивня, украшения (подвески из зубов мелкого хищника, представительная коллекция каменных орудий.
В 1996 году при строительстве подземных гаражей по Сопочной улице (микрорайон Николаевка) найдены единичные артефакты палеолитического облика. Местонахождение получило название Афонтова гора V.
В 1997 году Е. В. Артемьевым проводятся археологические исследования на новом памятнике. В результате обнаружена коллекция каменного инвентаря и фауны. Радиоуглеродное датирование позволило соотнести эти материалы с каргинским временем (28 000 — 32 000 лет).
В результате археологических исследований по уточнению границ Афонтовой горы II в зоне строительства 4-го моста через Енисей в 2011—2013 годах (Артемьев Е. В.) были получены данные, свидетельствующие о том, что территория памятника значительно более протяжённая, чем считалось ранее (до 70 тыс. м²).
В 2013 году были опубликованы результаты изучения ДНК индивида AG-2 со стоянки Афонтова гора 2, показавшие сходство афонтовца с мальчиком MA-1 со стоянки Мальта́^[2].
В 2014 году на Афонтовой горе найдена нижняя челюсть человека, жившего 12—14 тыс. лет назад^[3]. Своеобразие материалов позднего палеолита позволило выделить на Енисее особую афонтовскую культуру, для которой характерны орудия на каменных отщепах с разнообразными костяными наконечниками, а также продукты микролитической индустрии^[4].
В 2015 году у двух индивидов, живших на стоянке Афонтова гора в эпоху поздней бронзы (926—815 лет до н. э.), были обнаружены Y-хромосомная гаплогруппа R1a и митохондриальная гаплогруппа F1b^[5].

Ученые установили происхождение гладиаторов из Йорка

«Пальцы вниз» (Pollice Verso), Жан-Леон Жером, 1872
Wikimedia Commons

Новое исследование, в котором были использованы изотопный анализ и изучение генома, помогло установить происхождение людей, останки которых были найдены в 200-х годах на кладбище римской эпохи в городе Йорк.

Захоронение имело возраст около 1800 лет. Всего были найдены останки более 80 человек – все они были мужчинами в возрасте до 45 лет. Большинство похороненных были обезглавлены до или сразу после смерти, а их головы были погребены вместе с телами, будучи положены в могилу в ногах, между ног или на груди покойных. На скелетах также осталось много следов от прижизненных травм, среди которых были как нанесенные холодным оружием, так и оставленные зубами крупных хищников.

ДНК талисмана

 
Пума Ниттани
Ben Stanfield/Flickr

В университетах США все шире распространяется движение по прочтению геномов животных, которые служат их талисманами, сообщает The Wall Street Journal. Успешное завершение проекта по секвенированию генома своего талисмана становится поводом для гордости студентов и сотрудников университета, а также для насмешек над представителями других учебных заведений, которые до сих пор этого не сделали.

«По ошибке с Алексеем сожгли фрейлину»: завершается экспертиза царских останков

РИА Новости

   С конца 1970-х годов учёные занимаются идентификацией останков императора Николая II, императрицы Александры Фёдоровны и царских детей. Недавно патриарх Кирилл заявил, что экспертиза останков находится на завершающей стадии. Как проходили поиски и как удалось убедиться, что найдена именно царская семья?

Чистый дом в четыре комнаты

Секвенирование генома будут проводить в космосе

Энди Файнберг проводит эксперимент в условиях невесомости
(фото NASA/Regan Geeseman).

После 160 моделирований условий невесомости на борту самолёта NASA исследователи получили первые доказательства того, что секвенирование генома можно проводить и в космосе.

Генетики Эндрю Файнберг (Andrew Feinberg) и Линдси Риццарди (Lindsay Rizzardi) из университета Джона Хопкинса в Балтиморе с 15 по 18 сентября 2015 года проводили эксперименты в параболических полётах, имитирующих условия нулевой гравитации.

Эль-Сидрон

Материал из Википедии — свободной энциклопедии

Эль-Сидрон
43°23′01″ с. ш. 05°19′44″ з. д. (G) (O) (Я)Координаты: 43°23′01″ с. ш. 05°19′44″ з. д. (G) (O) (Я) Показать географическую карту
Страна	Испания
Регион	Астурия
Район	Пилонья
Длина	600 м
Эль-Сидрон
Эль-Сидрон

Эль-Сидро́н (исп. Cueva de El Sidrón) — пещеры в приходе Borines муниципалитета Пилонья (Астурия) в северо-западной части Испании.
Пещера достигает примерно в 600 м в длину^[1].
Известна находками изображений палеолитического наскального искусства и останков неандертальцев.
В 1994 году спелеологами случайно^[2] были найдены останки по меньшей мере 12 неандертальцев, которые жили 49 тыс. л. н. и были съедены другими неандертальцами: трёх мужчин, трёх мальчиков-подростков, трёх женщин и трёх детей^[3]. У неандертальцев из пещеры Эль-Сидрон была частично секвенирована митохондриальная ДНК.

Жертва проказы и родственник неандертальцев

Большая берцовая кость GC96
PLOS ONE

Прогресс, достигнутый в последние годы в технологии секвенирования ДНК, позволяет ученым узнавать все новые и новые подробности о жизни и здоровье наших далеких предков. Еще сравнительно недавно для успешного секвенирования генома необходимо было выделить из древних останков много молекул ДНК, то теперь достаточно небольшого количества. Усовершенствовались также специальные программы, которые позволяют реконструировать цепочку ДНК из отдельных фрагментов. За последние несколько дней ученые сообщили о двух интересных исследованиях, ставших возможными благодаря этому прогрессу.

Расшифровка генома неандертальца

Материал из Википедии — свободной энциклопедии

Институт эволюционной антропологии имени Макса Планка, Лейпциг

В июле 2006 года Институт эволюционной антропологии имени Макса Планка в Германии и компания 454 Life Sciences в США объявили о начале работы по секвенированию полного генома неандертальца^[1].
Геном неандертальца по размеру близок к геному современного человека. Предварительные результаты показывают, что ДНК современного человека и неандертальца идентичны приблизительно на 99,5%. Исследователи извлекли ископаемую ДНК неандертальца из кости бедра скелета неандертальца 38000-летней давности из пещеры Виндия в Хорватии, а также из других костей, найденных в Испании, России и Германии^[2][3].

110 000-летний зуб рассказал о генетическом разнообразии Денисовского человека

Биолог Сванте Паабо из Института эволюционной антропологии общества Макса Планка совместно с российскими коллегами из нескольких университетов секвенировал ядерный и митохондриальный геном коренного зуба Денисовского человека. Анализ ДНК показал, что для Денисовских людей характерно очень высокое генетическое разнообразие, значительно превышающее разнообразие их ближайших родственников – неандертальцев, однако все же меньшее, чем у современных людей. Работа опубликована в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences.

Зуб Денисовского человека.

Фотография: Bence Viola / Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology

Эксперты вскрыли гробницу Александра III и взяли пробы для анализа ДНК-образцов

Вице-губернатор Петербурга Владимир Кириллов отметил, что гробница императора не вскрывалась в советские годы

   Эксперты завершили вскрытие гробницы императора Александра III в рамках продолжающегося расследования по делу о гибели членов императорского дома и произвели отбор проб для генетического анализа ДНК-образцов для сравнения с предполагаемыми останками императора Николая II. Об этом ТАСС сообщил источник в межведомственной рабочей группе, отметив, что все работы проводились в присутствии представителей СК, правительства России и РПЦ.

Длину поколения вычислили по неандертальцам

Метод «рекомбинантных часов» для датировки древних образцов и для определения длины поколения

Новый метод молекулярно-генетической датировки, предложенный в статье команды Дэвида Райха, основан на сравнении древних и современных геномов по длине неандертальских фрагментов ДНК.  В отличие от радиоуглеродной датировки, этот метод  точнее работает на более старых образцах. С его помощью авторы также вычислили длину поколения (26-30 лет), предположив, что она существенно не менялась за 45 тысячелетий.

Y-хромосома стала барьером на пути метисации сапиенсов с неандертальцами

Работа в пещере Эль-Синдрон, Испания (фото CSIC Communicacion)

Секвенирование Y-хромосомы неандертальца показало, что метисация не коснулась этой части генома человека

Исследователи из Стэнфордского университета, проанализировав Y-хромосому неандертальцев, убедились в том, что в Y-хромосоме современного человека нет неандертальских фрагментов ДНК, в отличие от остальной части генома. Этому факту они постарались дать объяснение. Скорее всего, дело в антигенах гистосовместимости, которые препятствовали рождению мальчиков с неандертальскими генами в Y-хромосоме.

Детальное изучение генома гориллы

В последнем номере журнала Science опубликованы результаты секвенирования генома гориллы по технологии «выравнивания длинных последовательностей» (Long-read sequence assembly). Такая технология дала возможность гораздо точнее картировать расположение генов, полиморфных участков и повторов. Были секвенированы 87% пропущенных ранее экзонов (кодирующих белки участков).

Коммунальная пещера: новый сюрприз из Денисовой (с 1 апреля!)

Секвенирован новый ископаемый подвид человека - предок «снежного человека» и носитель гаплогруппы R1a

Сенсационное открытие, опубликованное сегодня, переворачивает наши представления об истории рода Homo, которая оказалась еще более удивительной. Находка поджидала исследователей в знаменитой Денисовой пещере на Алтае, которая не перестает снабжать науку своими сюрпризами. Именно здесь были найдены фрагменты (фаланги пальцев и зубы), принадлежащие денисовскому человеку, третьему виду рода Homo, жившему на просторах Евразии одновременно с сапиенсами и неандертальцами. Останки неандертальцев тоже были найдены в Денисовой пещере, так что, вероятно, они заселяли эту пещеру то ли одновременно с денисовцами, то ли по очереди — в общем, не пещера, а коммунальная квартира .
Но оказалось, что в этой квартире имелись и еще не учтенные ранее жильцы.

У негроидов есть примеси эректусов или других несапиенсных видов

 Африканские пигмеи биака. 

Наши предки заглядывались не только на неандертальских мужчин и женщин, но, по всей видимости, и на более архаичных хомо эректусов и хомо хабилис, живших в Африке, установили американские генетики.

 

Сценарий, согласно которому анатомически современный человек, или неоантроп (именно такое обозначение многие палеоантропологи предпочитают более расплывчатому Homo sapiens), сформировался в Африке и далее расселился по Евразии, Океании, Австралии и Америке, можно считать более или менее общепринятым.

DNA Tests Our tests are designed to deliver the best results and provide you with the most advanced tools to tackle any genetic genealogy

DNA Tests

Our tests are designed to deliver the best results and provide you with
the most advanced tools to tackle any genetic genealogy challenge.

	Best for	Specifications		What you get	Price
	Genealogy History Ancestry	Autosomal		Family Finder Matches Ethnic Percentages	$79 Learn More
	Genealogy History Ancestry	Autosomal + 37 markers		Male-specific bundle includes Family Finder plus our Y-chromosome test that analyzes 37-markers.	$248 Males only
	Genealogy History Ancestry	Autosomal + 67 markers		Male-specific bundle with all the bells and whistles! Family Finder plus our 67 marker Y-DNA test.	$347 Males only
	Genealogy History Ancestry	Autosomal + mtFull Sequence		Family Finder plus a Full Mitochondrial Sequence - For both males and females, our mtDNA test traces your maternal line.	$278
Father's Line					Learn More
	Genealogy History Ancestry	37 markers			$169 Males only
	Genealogy History Ancestry	67 markers		Connect to matches Free access to group projects & experts on your lineage Automated updates to your results Free webinars with a professional genetic genealogist Personalized customer support Uncover up to 340,000 years	$268 Males only
	Genealogy History Ancestry	111 markers			$359 Males only
Mother's Line					Learn More
	History	HVR1+HVR2		Connect to matches Free access to group projects & experts on your lineage Automated updates to your results Free webinars with a professional genetic genealogist Personalized customer support Discover up to 180,000 years	$79
	Genealogy History	Full Sequence			$199

Autosomal Transfers

Transfer your data from 23andMe© or AncestryDNA™
to find new matches in our database.

Try it Free

Y-DNA Transfers

Transfer your Y-DNA results from Ancestry™ now! Upgrade to see your matches, trace your paternal ancestry and join surname projects.

Learn More

National Geographic's Genographic Project Transfers

Transfer your National Geographic's Genographic Project for FREE to find your relatives and get additional insight on your ancestral origins.

Transfer Now

Comprehensive Genome

Family Finder, plus a male specific Y-chromosome test and a Full Mitochondrial Sequence

The most comprehensive and highest resolution mtDNA test. Results identify the ethnic and geographic origin of the maternal and paternal lines.

$546

• 
  
• 
  
• 
  
• 
  
• 
  
• 
  
• 
  
• 
  

Family Tree DNA is the testing partner for National Geographic’s Genographic Project.

• Community
  • Projects
  • Forums
  • News Blog
  • FTDNA Branded Merchandise
• Resources
  • Audio & Video
  • Books & Videos
  • Glossary Of Terms
  • Learning Center
  • Scientific Papers
  • Webinars
• About
  • Who’s Who at FTDNA
  • Careers
  • Contact Us
  • Products

© All Contents Copyright 2001-2016 Gene By Gene, Ltd. Privacy Policy, Terms of Service, and Refunds Last Updated 08/16/2016

 

https://www.familytreedna.com/products.aspx?ty=218 

Люди из пещеры Сима де лос Уэсос (Испания) – скорее предки неандертальцев, чем денисовцев

Сима де лос Уэсос, ненандертальцы, денисовцы, Сванте Паабо, Meyer

В статье, опубликованной в Nature  (первый автор Маттиас Мейер (Matthias Meyer ), один из соруководителей – Сванте Паабо), представлены результаты секвенирования последовательностей ДНК очень древних гоминид , найденных в пещере Сима де лос Уэсос в Испании, возраст которых оценивается приблизительно в 430 тыс лет.

Древнее население арктической Сибири было близко к европейцам?

Остров Жохова

Такой вывод делают исследователи митохондриальной ДНК древних обитателей Новосибирских островов

 Команда антропологов и генетиков из Санкт-Петербурга представила результаты исследования самых древних антропологических останков в Арктике – обитателей Жоховской стоянки (Новосибирские острова). Анализ мтДНК привел авторов к выводу, что 8 тысяч лет назад население арктической Сибири было ближе к европейским и уральским популяциям, а не к монголоидным популяциям Центральной и Восточной Сибири.