Отбор работает против неандертальской ДНК в нашем геноме

В статье, опубликованной в журнале PLoS genetics  предложено объяснение тому, почему, несмотря на имевшую место метисацию Homo sapiens с неандертальцами, эти  два вида человека не смешались и не разделили общую судьбу, а продолжали существовать отдельно. Авторы проанализировали в геномах современных людей ДНК-последовательности неандертальского происхождения.

Вероятность рождения близнецов зависит от двух генов

Близнецы
Pixabay

В Европе и Северной Америке на тысячу рождений приходится от 9 до 16 близнецов. В Латинской Америке и Южной Азии этот уровень ниже (6 – 9 на тысячу). А рекордно часто близнецы рождаются у африканского народа йоруба (45 – 50 на тысячу).

Отрывок из интервью газете "Комсомольская правда":

«На Западе в последнее время стали проводится серьёзные исследования, посвященные проблемам этнической и расовой изменчивости. Дело в том что надо делать скидку на Западную цивилизацию, потому что всё-таки народы отличаются удивительной отсталостью и дикостью - я имею ввиду Европу и Америку.
Простенькие вещи, которые были в общем-то известны в середине XIX века, из-за массовой полит-корректности, которую вводили в весь XX век, были хорошо забыты. На самом деле никто никогда не сомневался, что ещё со времён Древней Греции, этносы, этнические группы, даже небольшие, и тем более расы, они, различаются между собой.

"Расовая" кранотипия или краниометрия по набору стабильных краниальных маркеров. Преамбула

Originally posted by cts3402 at "Расовая" кранотипия или краниометрия по набору стабильных краниальных маркеров. Преамбула

Преамбула о «расовой» кранотипии

«Расовая» кранотипия явилась неожиданным плодом моих дискуссий с А.А.Клесовым в мае-июле 2010 г. У АК в то время появилась идея просто и доступно показать связь Υ-хромосомных гаплогрупп с головным указателем.

Если каждого гидроцефала считать пришельцем...

Станислав Владимирович Дробышевский

Научный редактор АНТРОПОГЕНЕЗ.РУ, к.б.н., доцент кафедры антропологии биологического факультета МГУ им. Ломоносова

Светлана Александровна Боринская

д. б. н., ведущий научный сотрудник лаборатории анализа генома Института общей генетики им. Н.И.Вавилова РАН

Влад  (письмо в Редакцию): Хочется сравнить физическую силу разных гоминид с современным человеком. Конечно, для сравнения стоит взять не офисного сидельца, а спортивного человека (но и не чемпиона мира). Насколько я понимаю, мы существенно уступаем в силе шимпанзе. А вот на каком этапе мы эту силу потеряли - я не знаю. Это уже позднее влияние цивилизации или оно произошло еще у предков?

Станислав Дробышевский: Проблема в том, как выяснить силу древнего человека? И что брать за образец, за норму? Проконсулы были мельче, чем шимпанзе, так что, вероятно, были примерно как мы или слабее нас.

Африканская и индейская примеси у белых американцев

С момента появления первых английских колоний в Северной Америке, территория будущих США стала ареной взаимодействия представителей трех крупных расовых комплексов - европеоидного, принесенного европейскими колонистами, местного америндного (индейского) и негроидного, связанного с рабами, завоз которых из Западной Африки начался в 1619 году. Но протяжении всей истории белые американцы составляли большинство населения сначала английских колоний, а потом и США.

При этом, удивительным представляется то, что им удалось сохранить изначальный облик и генофонд, привнесенный в Америку поселенцами и иммигрантами. В тоже самое время, афро-американцы и индейцы имеют заметную западноевразийскую примесь, что указывает на односторонний поток генов.

Ученые узнали о скрещивании людей с неизвестным видом

Фото: Wothe, K. / Arco Images GmbH / Globallookpress.com

Анализ геномов жителей Австралии и Океании указал на неизвестный вид Homo, с которыми предки современных людей скрещивались во время миграции из Африки в направлении Тихого океана. Об открытии сообщается в журнале Nature Genetics, а коротко о нем 26 июля рассказывает New Scientist.

Генетика первых земледельцев и их влияние на население Европы и Азии

Анализ древней ДНК с Ближнего Востока показал, что большой вклад в генофонд первых ближневосточных земледельцев внесла древняя линия базальных евразийцев;  что в пределах Ближнего Востока популяции земледельцев генетически различались по регионам, и между охотниками-собирателями и первыми земледельцами в каждом регионе имелась генетическая преемственность. Авторы также проследили вклад ближневосточных земледельцев в формирование более поздних популяций Европы и Азии. 

Люди начали заниматься земледелием около 10-9 тыс. лет до н.э. (то есть, 12-11 тыс. лет назад), на Ближнем Востоке, а в течение следующих пяти тысячелетий земледелие распространялось по Западной Евразии и за ее пределы.

Уточненные (совсем свежие) данные генетиков о заселении людьми современного типа Европы и Русской Равнины

 
Палеогенетические данные подтвердили, что создателями протоориньякской культуры были люди современного типа
Из молочного зуба возрастом около 40 000 лет, найденного в 1992 году в пещере Фумане на севере Италии, удалось извлечь древнюю ДНК и отсеквенировать митохондриальный геном. Геном оказался принадлежащим к гаплогруппе R, характерной для многих современных евразийцев и большинства палеолитических сапиенсов Евразии. Тем самым подтвердилась принятая точка зрения, согласно которой создателями так называемой протоориньякской культуры были именно сапиенсы, а распространение этой культуры в Европе связано с расселением людей современного типа, пришедших с Ближнего Востока и вскоре вытеснивших коренное неандертальское население.

The genetic history of Ice Age Europe

Modern humans arrived in Europe ~45,000 years ago, but little is known about their genetic composition before the start of farming ~8,500 years ago. Here we analyse genome-wide data from 51 Eurasians from ~45,000–7,000 years ago. Over this time, the proportion of Neanderthal DNA decreased from 3–6% to around 2%, consistent with natural selection against Neanderthal variants in modern humans. Whereas there is no evidence of the earliest modern humans in Europe contributing to the genetic composition of present-day Europeans, all individuals between ~37,000 and ~14,000 years ago descended from a single founder population which forms part of the ancestry of present-day Europeans.

Генетическая история Ледникового периода

Европа каменного века пережила несколько миграционных волн.

История освоения и заселения Европы людьми современного вида была несколько сложнее, чем считалось до этого – таковы выводы, сделанные профессором Гарвардской медицинской школы (США) Дэвидом Райхом (David Reich) и его коллегами, проанализировавшими ДНК из останков 51 жителя Европы каменного века. Останки охватывают промежуток длиной почти в 40 тысяч лет: самые ранние из них имеют возраст около 45 тысяч лет, а самые поздние – около 7 тысяч; результаты генетического анализа опубликованы в журнале Nature.


Черепа из Дольни-Вестонице (Чехия). Дата – около 31 тыс. л.н. Фото: Martin Frouz and Jirí Svoboda / Howard Hughes Medical Institute.

Палеогенетические данные подтвердили, что создателями протоориньякской культуры были люди современного типа

Рис. 1. Два молочных резца из протоориньякских местонахождений убежище Бомбрини (Riparo Bombrini) на западе Лигурийских альп и пещера Фумане (Grotta di Fumane) на самом севере Италии. B, L, O, M, D — виды с разных сторон (со стороны губ, языка, сверху и с двух боков). Длина масштабного отрезка 1 см. Изображение из обсуждаемой статьи в Science

Из молочного зуба возрастом около 40 000 лет, найденного в 1992 году в пещере Фумане на севере Италии, удалось извлечь древнюю ДНК и отсеквенировать митохондриальный геном. Геном оказался принадлежащим к гаплогруппе R, характерной для многих современных евразийцев и большинства палеолитических сапиенсов Евразии. Тем самым подтвердилась принятая точка зрения, согласно которой создателями так называемой протоориньякской культуры были именно сапиенсы, а распространение этой культуры в Европе связано с расселением людей современного типа, пришедших с Ближнего Востока и вскоре вытеснивших коренное неандертальское население.
Заселение Западной Европы людьми современного типа (сапиенсами) и вытеснение ими неандертальцев маркируется распространением верхнепалеолитической ориньякской культуры (Aurignacian), создателями которой традиционно считают сапиенсов.

Полные геномы пигмеев указали на африканскую метисацию современного человека с архаичными гоминидами

До сих пор метисация Homo sapiens с другими видами человека (с неандертальцами и денисовцами) была доказана только в Евразии. В Африке современные люди жили рядом с архаичными гоминидами гораздо дольше, в течение 200 тысяч лет. Но поскольку древняя ДНК в тропическом климате не сохраняется, невозможно проверить напрямую, были ли в Африке эпизоды метисации. Авторы статьи в журнале Genome Research пошли по другому пути. Они использовали данные полногеномного секвенирования (с покрытием более 60х) двух популяций западноафриканских пигмеев.

Горох оказался способным к азартным играм

Фото: Gary K. Smith / Arco Images / Globallookpress.com

Растения азартны и способны принимать рисковые решения. К такому выводу пришли израильские ученые, заставившие горох выбирать между горшками с разным количеством питательных веществ. Об открытии сообщается в журнале Current Biology, а коротко о нем рассказывает Science News.

Генетики подтвердили смешанное происхождение индийских евреев

Генетический анализ Бене-Исраэль в Индии уточнил легенды об их происхождении

Исследование показало, что популяция Бене-Исраэль, живущая в Индии, имеет смешанное еврейско-индийское происхождение. Причем вклад евреев передался в основном по мужским линиям наследования (по Y-хромосоме), а вклад индийцев – по женским (по мтДНК). Время же возникновения  популяции оказалось не столь давним, как в легендах.

Распространение митохондриальной гаплогруппы R0a на Аравийский полуостров и Африканский рог в позднем ледниковье

Карта распределения митохондриальной гаплогруппы R0a

В журнале Scientific reports опубликована статья, в которой прослеживаются пути распространения митохондриальной гаплогруппы R0a. Авторы подчеркивают, что иногда распределение  редкой гаплогруппы может дать ценную информацию о событиях глубокой истории. R0a наиболее часта у населения Аравийского полуострова и Африканского рога, хотя встречается гораздо более широко – от  Европы до Индии.

Мутация гемохроматоза возникла в неолитической Европе как адаптивная

Некоторые генетические варианты, в геноме современного человека ассоциированные с заболеваниями, когда-то в прошлом были адаптивными. Это выяснилось для аллеля C282Y, который сегодня является основной причиной гемохроматоза. Болезнь выражается в нарушении обмена железа в организме, при котором его избыточное количество накапливается в тканях и органах. Известно, что эта мутация возникла в Европе не раньше,  чем 6000 лет назад, и ее возникновение связывают с неолитической революцией.

Ландшафт денисовских включений в современный геном уточнили

В журнале Current Biology вышла еще одна статья, посвященная поиску ДНК древних видов человека в геномах современных людей (онлайн публикация). Команда Дэвида Райха, профессора Гарвардской медицинской школы в Бостоне, сосредоточила свое внимание на денисовцах, так как их генетический след в современном геноме изучен слабее, чем след неандертальцев. Поиски велись на большой базе – авторы использовали данные по секвенированию полных геномов 257 индивидов из 120 популяций мира, среди которых было 20 жителей Океании с большой долей денисовских предков в геноме. Используя свой собственный метод, исследователи получили уточненный генетический ландшафт с фрагментами неандертальского и денисовского происхождения.

Древняя ДНК напрямую показала адаптацию жителей Перу к высокогорью

древняя ДНК, Перу, высокогорье, отбор, адаптация, SNP, Fehren-Schmitz

Статья с результатами исследования приспособления перуанцев к жизни в высокогорье Анд, опубликованная в журнале Scientific reports, интересна тем, что демонстрирует еще одну область применения древней ДНК – прямую проверку эволюционных гипотез.

Гены управляют поведением, а поведение — генами

У самых разных представителей животного царства взаимоотношения с сородичами регулируются одними и теми же веществами — нейропептидами окситоцином, вазопрессином и их гомологами. Рис. из обсуждаемой статьи Donaldson & Young Журнал Science опубликовал серию обзорных и теоретических статей, посвященных взаимосвязи генов и поведения. Последние данные генетики и нейробиологии указывают на сложность и неоднозначность этой взаимосвязи. Гены влияют даже на такие сложные аспекты человеческого поведения, как семейные и общественные взаимоотношения и политическая деятельность. Однако существует и обратное влияние поведения на работу генов и их эволюцию. Гены влияют на наше поведение, но их власть не безгранична Хорошо известно, что поведение во многом зависит от генов, хотя о строгом детерминизме в большинстве случаев говорить не приходится. Генотип определяет не поведение как таковое, а скорее общее принципы построения нейронных контуров, отвечающих за обработку поступающей информации и принятие решений, причем эти «вычислительные устройства» способны к обучению и постоянно перестраиваются в течение жизни.