Темы

C Cеквенирование E E1b1b G I I1 I2 J J1 J2 N N1c Q R1a R1b Y-ДНК Австролоиды Альпийский тип Америнды Англия Антропологическая реконструкция Антропоэстетика Арабы Арменоиды Армия Руси Археология Аудио Аутосомы Африканцы Бактерии Балканы Венгрия Вера Видео Вирусы Вьетнам Гаплогруппы Генетика человека Генетические классификации Геногеография Германцы Гормоны Графики Греция Группы крови ДНК Деградация Демография в России Дерматоглифика Динарская раса Дравиды Древние цивилизации Европа Европейская антропология Европейский генофонд ЖЗЛ Живопись Животные Звёзды кино Здоровье Знаменитости Зодчество Иберия Индия Индоарийцы Интеръер Иран Ирландия Испания Исскуство История Италия Кавказ Канада Карты Кельты Китай Корея Криминал Культура Руси Латинская Америка Летописание Лингвистика Миграция Мимикрия Мифология Модели Монголоидная раса Монголы Мт-ДНК Музыка для души Мутация Народные обычаи и традиции Народонаселение Народы России Наши Города Негроидная раса Немцы Нордиды Одежда на Руси Ориентальная раса Основы Антропологии Основы ДНК-генеалогии и популяционной генетики Остбалты Переднеазиатская раса Пигментация Политика Польша Понтиды Прибалтика Природа Происхождение человека Психология РАСОЛОГИЯ РНК Разное Русская Антропология Русская антропоэстетика Русская генетика Русские поэты и писатели Русский генофонд Русь США Семиты Скандинавы Скифы и Сарматы Славяне Славянская генетика Среднеазиаты Средниземноморская раса Схемы Тохары Тураниды Туризм Тюрки Тюрская антропогенетика Укрология Уралоидный тип Филиппины Фильм Финляндия Фото Франция Храмы Хромосомы Художники России Цыгане Чехия Чухонцы Шотландия Эстетика Этнография Этнопсихология Юмор Япония генетика интеллект научные открытия неандерталeц

Поиск по этому блогу

среда, 8 февраля 2012 г.

ПРОИСХОЖДЕНИЕ ЧЕЛОВЕКА по данным археологии, антропологии и ДНК-генеалогии часть 5

6. Африканская гаплогруппа А

По состоянию на конец июля 2009 года база данных YSearch содержала 137 25-маркерных гаплотипов гаплогруппы А, и 107 из них были 37-маркерными. Это даёт возможность попытаться рассчитать, когда жили общие предки данной выборки.

При этом надо, конечно, понимать, что эта выборка не представляет в полной мере население Африки, имеющее гаплогруппу А. Поскольку это коммерческая база данных, то приведённые там представители гаплогруппы – достаточно обеспеченные люди. В их составе вряд ли есть представители африканских джунглей, хотя это не исключено в отношении их предков 200 – 300 лет назад.

Первый сюрприз в данном исследовании начался с рассмотрения состава данной выборки по странам. Из 137 человек эти данные сообщили в базе данных 96 человек, причем не о себе, а об их наиболее удалённых известных предках (см. табл. 6.1).

Страна

Численность, чел

США

49

Англия

17

Ирландия

10

Шотландия

6

Германия

4

Канада

3

Франция

2

Дания, Испания, Польша, Алжир и Швейцария

по 1

Таблица 6.1. Выборка по странам.

Не считая Алжира, об африканских предках в базе данных носители гаплогруппы А вообще не упоминали. Либо таких сведений у них не было, что довольно характерно для американских потомков африканских рабов, либо предпочли сведений не давать.

Вот как сообщает о гаплогруппе А сводка Международного Общества Генетической Генеалогии (ISOGG) за 2009 год:

Гаплогруппа А представляет старейшую ветвь на Y-хромосомном дереве человечества, которая, видимо, ведёт начало с 60000 лет назад. Подобно гаплогруппе В, линия А наблюдается только в Африке, и встречается по всему континенту. Она чаще всего встречается в Эфиопии и Судане, и среди популяций, говорящих на щёлкающих языках. Фрагментарное распределение этой гаплогруппы может свидетельствовать о том, что это – остатки древних ДНК-линий. Наиболее распространёнными субкладами гаплогруппы А являются А2, А3b1, иA3b2. Последняя встречается у 1,1% афроамериканцев.

Дополняющие сведения предоставляет работа [King et al, 2007]. Они дают сводку данных о появлении африканцев в северо-западной Европе, сообщают, что гаплогруппа А является древнейшей в филогении хромосомы Y (но количественных сведений не представляют), что она относится именно к Африке, и что из тестированных 3351 африканцев гаплогруппа А была обнаружена у 5,4%.

Авторы не комментируют эту цифру, но заметим, что это немного, и, видимо, остальные имели гаплогруппы В и Е (48% в Африке по данным той же статьи принадлежат только одному субкладу E3a).

В то же время, по данным авторов, вне пределов Африки гаплогруппу А имели всего семь человек, не относящих себя к африканцам (Турция, Кипр, Сардиния и Оман). Далее, субклад А1 был обнаружен в Мали только у одного человека из тестированных 44. А всего этот субклад был найден ещё у 25 человек из более тысячи тестированных – 2/64 (то есть двое из 64 тестированных) марокканских берберов, 3/766 афроамериканцев, 2/39 в Сенегале, 1/201 на острове Cape Verde, 14/276 в Гвинее-Биссау и 2/39 из Нигера.

От себя добавим, что сейчас, в середине августа 2009, через два года после публикации статьи Кинга, база данных YSearch насчитывает всего 12 человек в разделе гаплогруппы А1 – из США (4), Англии (2), Ирландии (2), Германии (1), и трое не дали сведений. Никто не упомянул африканское происхождение.

В литературе имеются отрывочные сведения об обнаруженных носителях гаплотипов гаплогруппы А в Европе. Сообщалось о нахождении гаплотипа гаплогруппы А в Англии, двигаясь от которого удалось выявить целую «классическую» генеалогическую группу английских родственников из семи человек с гаплогруппой А [King et al, 2007]. Предковый гаплотип всей группы (в формате DYS 393, 390, 19, 391, 385a (пропущен), 385b (пропущен), 426 (пропущен), 388, 439, 389-1, 393, 389-2 – 434, 435, 436, 437, 438, 439, 460, 451, 462) следующий:

14-23-16-10-Х-Y-Z-10-10-12-11-29 – 12-12-11-14-8-11-11-12-12

и на все 17×7=119 маркеров было всего три мутации. Используя константу скорости мутации, приведенную в таблице 5.2.3.1.2, получаем, что общий предок всех семи человек жил 3/119/0.00141 = 18 поколений, или 450±260 лет назад. Но поскольку на дополнительных 60 маркерах была только одна мутация, то общий предок, видимо, жил ещё позже. Авторы [King et al, 2007] оценивают, что он жил 140±80 лет назад.

Сравнение с базовыми гаплотипами гаплогруппы А (см. ниже) показывает, что гаплотип общего предка английских носителей той же гаплогруппы отличается от них очень значительно, а именно на 13 и12 мутаций на 9 маркерах, и помещает общего предка древних африканцев и их потомков англичан с гаплогруппой А на 24 и 30 тысяч тысяч лет назад при расчёте по двум ветвям африканского дерева гаплотипов (рис. 6.1), относительно молодой ветви (в верхней части дерева) и старой ветви (нижняя часть дерева), соответственно.

Сообщалось об одном русском (Калужская область) и двух поляках (гг. Вроцлав и Быдгощ), у которых нашли гаплогруппу А [Малярчук, 2009]. Все три гаплотипа имели явно общего предка, поскольку 36 маркеров у всех троих в сумме показали всего две мутации от 12-маркерного базового гаплотипа (в формате DYS 393, 390, 19, 391, 385a, 385b, Х, Y. 439, 389-1, 392, 389-2, 437, 438)

13-21-15-9-11-12-Х-Y-12-14-11-32 – 16-10

где X и Y – пропущенные маркеры DYS426 и DYS388. В таблице 5.2.3.1.2 есть константа скорости для приведённого формата гаплотипа, равная 0.00197 мутаций на маркер на поколение. Для двух мутаций на 36 маркеров это указывает, что общий предок всех трёх человек жил 725±520 лет назад, в средние века.

Сравнение с базовыми гаплотипами гаплогруппы А (см. ниже) показывает, что гаплотип общего предка русского и поляков отличается от них очень значительно, а именно на 12 – 16 мутаций на 12 маркерах, и помещает общего предка древних африканцев и славян с гаплогруппой А на 22 и 30 тысяч тысяч лет назад при расчёте по двум ветвям африканского дерева гаплотипов (рис. 6.1), относительно молодой ветви (в верхней части дерева) и старой ветви (нижняя часть дерева), соответственно.

Интересно, что базовые гаплотипы англичан и славян гаплогруппы А различаются на огромную величину (10 мутаций на 8 маркерах), а общий предок с африканцами по времени один и тот же. Ясно, что он находился в Африке, потому что, как показано ниже, общий предок африканских ветвей гаплогруппы А жил примерно 28 тысяч лет назад. Это – одно и то же время, в пределах погрешности расчётов, тем более по таким древним ветвям. В то же время разница в 10 мутаций на восьми маркерах у базовых гаплотипов англичан и славян гаплогруппы А разносит их общих предков суммарно почти на 29 тысяч лет, и помещает их на 15 тысяч лет назад. Именно тогда было положено начало африканской линии, которая разошлась на английскую и восточноевропейскую части. Как и когда попали эти африканцы на европейский континент – можно только гадать. Скорее всего попали уже относительно недавно, но независимо продолжили свои древние генеалогические линии.

Теперь рассмотрим гаплотипы гаплогруппы А уже в массовом виде, в количестве 107 37-маркерных гаплотипов из базы данных Ysearch (рис. 6.1). Как уже отмечалось, дерево состоит из двух основных линий, «старой» (в нижней части дерева) и «молодой» (в верхней части).

Рис. 6.1. Дерево 37-маркерных гаплотипов гаплогруппы А. 107 гаплотипов собраны в базе данных YSearch

«Молодая» ветвь состоит из 69 гаплотипов, и в ней содержится 440 мутаций от базового 25-маркерного гаплотипа (приведен 37-маркерный гаплотип)

13 24 14 11 11 14 12 12 12 13 13 29 – 17 9 10 11 11 25 15 19 29 15 15 17 17 – 11 11 19 23 16 15 18 17 36 38 12 12

Это даёт время жизни общего предка ветви 4050±450 лет назад.

Базовый 25-маркерный гаплотип нижней ветви из 38 гаплотипов

13 22 14 10 13(14) 15 11 14 12 13 11 29 – 16 8 9 9 11 23 15 20 30 12 14 15 16

на 27.5 мутаций (выделены) на 25 маркерах отличается от «молодого» базового гаплотипа. Все 38 гаплотипов содержат 812 мутаций, что дает 20650±2200 лет до общего предка ветви. По разнице в мутациях между базовыми гаплотипами двух основных ветвей можно рассчитать возраст ИХ общего предка. Он жил примерно 28200 лет назад.

Это намного меньше, чем обычно предполагается для общего предка гаплогруппы А. Или рассмотренная в данном исследовании серия гаплотипов не является представительной для гаплогруппы, или гаплогруппа не столько древняя, как представляется. Возможно и то, и другое. Будущие исследования скорректируют наши представления.

Здесь надо подчеркнуть, что носители гаплогрупп А и В из Африки в те далекие времена, примерно 70 – 60 тысяч лет назад, не выходили. Или выходили, но потомки не выжили. Эти две гаплогруппы остаются африканскими и сейчас (не считая, конечно, потомков вывезенных рабов, или другие частные – в данном контексте – варианты).


7. Африканская гаплогруппа В

Гаплогруппа В далеко не так широко представлена в базе данных Ysearch по сравнению с гаплогруппой А – там оказалось только пятнадцать 25-маркерных (и 37-маркерных) гаплотипов. Наиболее удалённые (по времени) известные предки представленных там людей жили в США (6 человек), на Багамских островах, Ямайке и Анголе (по одному человеку). Это уже ближе к чернокожим, отчасти и потому, что большинство написали, что предки им не известны, или дали совсем близкие даты, конец 19-го – 20-й век. Это характерно для афроамериканцев и чернокожих островитян. Рабство по своей природе не располагало к занятиям генеалогией и уничтожало память о предках. У рабов в США, как правило, вообще не было семей, и даже отцы зачастую не были детям известны.

Дерево гаплотипов представлено на рис. 7.1.

Если дерево рассматривать всё целиком, не обращая внимания на ветви, то оно содержит 308 мутаций от базового гаплотипа

13 23 15 10 11 12 11 12 12 13 11 31 – 16 8 9 10 11 26 14 20 35 15 16 17 18

что даёт 19400±2200 лет до общего предка. Но обычно при таком рассмотрении, пренебрегая ветвями, общий предок «омолаживается». Для проверки этого положения рассмотрим все четыре ветви данного дерева (пятая – дочерняя ветвь с временем до общего предка 3400±1100 лет). Их базовые гаплотипы – сверху дерева вниз по часовой стрелке:

13 23 15 11 11 12 11 10 12.5 14 11 33 – 16 8 8 10 11 26 14 21 38 16 16 18 18

14 24 15 10 10 13 11 13 11    12 11 30 – 17 9 9 11 12 27 14 19 29 14 14 16 18

13 22 14 10 12 16 11 14 12    13 15 30 – 15 9 9 7 11 27 14 21 33 13 14 15 16

13 22 16 10 12 12 11 13 11    13 11 29 – 18 8 9 11 11 23 14 19 30 15 16 17 18

Эти базовые гаплотипы предположительно были у общих предков ветвей, которые жили 2725±700, 9500±1800, 10900±2000, и 8850±1700 лет назад, соответственно. Все четыре базовых гаплотипа содержат 78 мутаций от ИХ общего предкового, что помещает их общего предка примерно на 25900 лет назад. Действительно, обработка всего дерева «на круг» привела к потере более 6 тысяч лет для времени жизни общего предка. Его предположительный гаплотип следующий:

13 23 15 10 11 12 11 13 12 13 11 31 – 16 8 9 10 11 26 14 20 33 15 16 17 18


Рис. 7.1. Дерево пятнадцати 25-маркерных гаплотипов гаплогруппы В (собраны в базе данных Ysearch).

Поскольку мы знаем базовый гаплотип древней ветви гаплогруппы А

13 22 14 10 13.5 15 11 14 12 13 11 29 – 16 8 9 9 11 23 15 20 30 12 14 15 16

с возрастом 20650±2200 лет, то можно попытаться рассчитать возраст общего предка гаплогрупп А и В. Между их базовыми гаплотипами 25 мутаций на 25 маркерах, что разводит их общих предков суммарно на 26850 лет и помещает их примерно на 36700 лет назад.

Вот это, видимо, и есть более правильный возраст гаплогруппы А.


8. «Монголоидная», или «австралоидная» гаплогруппа С

Гаплогруппа В далеко не так широко представлена в базе данных Ysearch по сравнению с гаплогруппой А – там оказалось только пятнадцать 25-маркерных (и 37-маркерных) гаплотипов. Наиболее удалённые (по времени) известные предки представленных там людей жили в США (6 человек), на Багамских островах, Ямайке и Анголе (по одному человеку). Это уже ближе к чернокожим, отчасти и потому, что большинство написали, что предки им не известны, или дали совсем близкие даты, конец 19-го – 20-й век. Это характерно для афроамериканцев и чернокожих островитян. Рабство по своей природе не располагало к занятиям генеалогией и уничтожало память о предках. У рабов в США, как правило, вообще не было семей, и даже отцы зачастую не были детям известны.

Это, видимо, старейшая гаплогруппа за пределами Африки. По классификации 2009 года, она состоит из семи подгрупп – одна та, которая так и осталась со своим исходным снипом, и носители которой не имеют никаких других «нисходящих» снипов подгрупп С (эту исходную гаплогруппу называют гаплогруппой С*), и подгруппы от С1 до С6. Они, в свою очередь, разделяются на 18 подгрупп, каждую из которых можно условно назвать «племенем», потому что их носители в известной степени родственники более близкие, чем носители других подгрупп. Эти племена во времени разделяются, как правило, тысячелетиями, но возможны и века. Это вопрос ещё ждёт своих исследователей.

Самая обширная гаплогруппа – С3, которая состоит из самой С3* («тупиковой») и шести подгрупп. По легендам, которыми так богата ДНК-генеалогия, гаплогруппу С3 имел Чингиз-хан [Zerjal et al, 2003], и потому она столь обильно представлена на завоеванных им и его сыновьями и потомками территориях. Эта легенда базируется в основном на фантазиях и допущениях. Данные по чингизидам (или якобы чингизидам) довольно противоречивы.

База данных Ysearch содержит только пятнадцать 25-маркерных (и более протяжённых) гаплотипов в разделе С. Из них три отмечены как С*, остальные – как С, что может включать и прочие подгруппы. Их далеко не всегда определяют. Эти 15 человек отметили в качестве своих наиболее удалённых известных им предков – пять из США (один как С*), три из Ирландии (двое С*), и по одному из Англии, Германии, Испании, Швейцарии, Чехословакии и Объединённых Арабских Эмиратов. Дерево их гаплотипов представлено на рис. 8.1.


Рис. 8.1. Дерево пятнадцати 25-маркерных гаплотипов гаплогруппы С (собраны в базе данных Ysearch).

Слева – малая отдельная группа из четырёх гаплотипов, с общим предком 3250±780 лет назад (21 мутация на всю ветвь) и базовым гаплотипом

14 24 14/16 9 11 13 11 13 11 13/14 11 30/31 18 9 9 11 11 27 14 19 25 15 16 16 16/17

Это вполне может быть и одна из подгрупп со своим снипом, но сведений об этом нет. Это может быть и дочерняя ветвь общего предка для всей гаплогруппы С, то есть всей остальной части дерева (что не противоречит предыдущему предположению и в целом согласуется с возрастом ветви и различиям в мутациях с остальной частью дерева). Базовый гаплотип всего дерева

13 24 14 9 11 16 11 13 11 14 11 31 18 8 9 11 11 26 14 19 25 14 16 16 17

Гаплотипы всего дерева имеют от него 274 мутации, что уже показывает, что гаплогруппа древняя. Расчёт приводит к выводу, что все 15 гаплотипов происходят от общего предка, который жил 16100±1900 лет назад.

Серия из восьми 25-маркерных (и более протяжённых) гаплотипов гаплогруппы С3, представленная организаторами казахского проекта по ДНК-генеалогии www.elim.kz, представляет казахские рода торе, дулат и тана, киргизский род и казахский неидентифицированный род, содержит 62 мутации в 25-маркерных гаплотипах, что указывает, что общий предок всех восьми человек жил 5100±820 лет назад. Неизвестно, жили ли его потомки все пять тысячелетий на том же месте, в степях Казахстана и горах и равнинах Киргизии, или это продукт относительно недавних миграций с востока, возможно, и в нашей эре.

Мигранты вполне могли «принести» маркеры древнего предка в своих ДНК, не пройдя «бутылочного горлышка» популяции, или «горлышко» было пять тысяч лет назад. Как видно, без привлечения независимых данных ДНК-генеалогия представляет простор для многих альтернативных вариантов. Что важно – если расчёт основывать не на этих восьми людях (четверо из них принадлежат роду торе), а на базовых гаплотипов родов, то базовые гаплотипы пяти родов содержат 39 мутаций, что опять даёт «возраст» общего предка 5100±960 лет, но с большей погрешностью, поскольку гаплотипов и мутаций в них меньше, статистика хуже представлена.

История монголоидных вторжений в Центральную Азию ещё ждёт своих исследователей. Это – во многом территории андроновской археологической культуры, которые 3 – 4 тысячелетия назад занимал род R1a1, прибывший из Европы. Об этом речь ниже.

8.1. Полинезийцы (гаплогруппа С2)

У полинезийцев – маори (Новая Зеландия), жителей островов Кука, и самоанцев – гаплогруппа С2. У них суммарно было определено 37 десятимаркерных гаплотипов [Zhivotovsky et al, 2004], и наиболее распространённым оказался следующий (в формате FTDNA плюс DYSA72, он же DYS461):

14-20-16-10-Х-Х-Х-15-13-12-12-30 – 9

Дерево гаплотипов приведено на рис. 8.1.1.


Рис. 8.1.1. Дерево 10-маркерных гаплотипов полинезийцев гаплогруппы С2. В выборке – 37 гаплотипов. Источник гаплотипов – статья [Zhivotovsky et al, 2004].

Из дерева гаплотипов неясно, один предок для всех или несколько. Проверим по критерию сходимости линейного и логарифмического методов.

От приведенного выше базового гаплотипа все 37 гаплотипов имеют 49 мутаций. Константа скорости мутации для указанных 10-маркерных гаплотипов равна 0.0018 мутаций на маркер на поколение (Табл. 5.2.3.1.2). Таким образом общий предок всех 37 гаплотипов жил 49/37/10/0.0018 = 74 поколения (без поправки на возвратные мутации), или 80 поколений (с поправкой), то есть 2000±350 лет назад.

На дереве – 8 базовых гаплотипов (на вершине верева). Это даёт ln(37/8)/0.018 = 85 поколений (без поправки) или 93 поколения (с поправкой), то есть 2325 лет. Это – в пределах погрешности расчётов. На самом деле разница в 16% между логарифмическим и линейным методами может означать небольшую примесь потомков ещё одного общего предка в серии, но погрешность от этого, как мы видим, невелика.

Источники отмечают, что предполагаемое время прибытия маори в Новую Зеландию варьируется от 700 – 650 лет до 1000 – 800 лет и даже до 1200 лет назад [Zhivotovsky et al, 2004]. Или источники ошибаются, или, скорее всего, в Новую Зеландию прибыл не один человек маори, который и начал новую генеалогическую линию, а группа людей, которые и «принесли в своих ДНК более раннего общего предка» из тех мест, из которых прибыли. Это – совершенно типичная ситуация в ДНК-генеалогии. По тому же принципу евреи в Биробиджане будут иметь общего предка не в 1930-х годах, а тысячи лет назад.