drfaust_spb в Два полюса в генофонде северо-востока Европы
Несколько графиков и тезисов из свежей публикации о генетическом разнообразии населения Северо-Восточной Европы. Ничего революционного, просто заострение деталей.
Для анализа были привлечены 16 популяций в составе 615 образцов ДНК, давших в сумме 166 000 аутосомных SNP, из которых 384 образца в 8 популяциях — с территории России. Ниже карта, диаграммы главных компонентов и структуры (большие по клику). Само исследование: A Genome-Wide Analysis of Populations from European Russia Reveals a New Pole of Genetic Diversity in Northern Europe, Khrunin et al., 2013.
Из диаграммы видно, что первый главный компонент выделяет средиземноморскую примесь, достигающую пика у итальянцев и убывающую в направлении на северо-восток: немцы, чехи и поляки — ближе к итальянцам; латыши (наконец данные по ним вошли в оборот) и русские Центральной России — в одном кластере и с меньшим южным влиянием; ещё дальше расположились более северные популяции.
Второй главный компонент здесь более любопытен: он отделяет финнов от населения Русского Севера. На полярные точки приходятся (внимание на карту) финны-изоляты из Куусамо и ижемские/прилузские коми, промежуточное положение занимают финны из Хельсинки, вепсы и русские из Мезени. Статистический анализ выявил высокий генетический дрейф в образцах Куусамо и ижемских коми, средний — в образцах из Прилузского района, Хельсинки, Мезени и вепсов. Именно генетическому дрейфу эти образцы обязаны своим значительным разнообразием и высокой дисперсией на диаграмме. (По части следов дрейфа на этой диаграмме дискуссия была у Dienekes, в ходе которой приводилась такая карта для финнов и финнов-изолятов.) Тем не менее, финские и континентальные образцы ясным образом разделяются вторым главным компонентом.
Ещё более явным это различие становится на структурной диаграмме при переходе от К=3 к К=4, где финны и ижемские коми из одного общего кластера выделяются в два совершенно различных (у обоих занимает по 90%), а вепсы, Мезень, Прилузский район включают эти два кластера ровно поровну. В дальнейшём (К=8) последние три популяции образуют собственные кластеры. Полная диаграмма по клику.
Резюмируя:
1. Население отдалённых районов северо-востока Европы показывает высокое разнообразие вследствие изоляции, эндогамии и генетического дрейфа.
2. Население Финляндии и Прибалтики с одной стороны и Русского Севера — с другой, образуют два полюса генетического разнообразия в Северо-Восточной Европе. Третий полюс — континентальные северо-восточные европейцы, жёлтый на K=5 — достигает пика среди латышей, русских, эстонцев и поляков.
P.S. В международной базе данных HGDP находятся данные о ДНК русских, которые здесь обозначены как Rus_HGDP. Они нерепрезентативны и формируют искажённое представление о русском генофонде, чем доставляют массу радости западным обывателям, давая возможность легко отождествлять русских с финнами и подтверждать миф о русских как «финно-кацапах». Не смотря на то, что доля восточно-азиатского компонента у русских не больше, чем у итальянцев.
