Темы

C Cеквенирование E E1b1b G I I1 I2 J J1 J2 N N1c Q R1a R1b Y-ДНК Австролоиды Альпийский тип Америнды Англия Антропологическая реконструкция Антропоэстетика Арабы Арменоиды Армия Руси Археология Аудио Аутосомы Африканцы Бактерии Балканы Венгрия Вера Видео Вирусы Вьетнам Гаплогруппы Генетика человека Генетические классификации Геногеография Германцы Гормоны Графики Греция Группы крови ДНК Деградация Демография в России Дерматоглифика Динарская раса Дравиды Древние цивилизации Европа Европейская антропология Европейский генофонд ЖЗЛ Живопись Животные Звёзды кино Здоровье Знаменитости Зодчество Иберия Индия Индоарийцы Интеръер Иран Ирландия Испания Исскуство История Италия Кавказ Канада Карты Кельты Китай Корея Криминал Культура Руси Латинская Америка Летописание Лингвистика Миграция Мимикрия Мифология Модели Монголоидная раса Монголы Мт-ДНК Музыка для души Мутация Народные обычаи и традиции Народонаселение Народы России Наши Города Негроидная раса Немцы Нордиды Одежда на Руси Ориентальная раса Основы Антропологии Основы ДНК-генеалогии и популяционной генетики Остбалты Переднеазиатская раса Пигментация Политика Польша Понтиды Прибалтика Природа Происхождение человека Психология РАСОЛОГИЯ РНК Разное Русская Антропология Русская антропоэстетика Русская генетика Русские поэты и писатели Русский генофонд Русь США Семиты Скандинавы Скифы и Сарматы Славяне Славянская генетика Среднеазиаты Средниземноморская раса Схемы Тохары Тураниды Туризм Тюрки Тюрская антропогенетика Укрология Уралоидный тип Филиппины Фильм Финляндия Фото Франция Храмы Хромосомы Художники России Цыгане Чехия Чухонцы Шотландия Эстетика Этнография Этнопсихология Юмор Япония генетика интеллект научные открытия неандерталeц

Поиск по этому блогу

суббота, 2 июля 2016 г.

Структура генофонда Европы в зеркале полногеномных маркеров. I Фрагмент из книги «Генофонд Европы»

АНАЛИЗ В МИРОВОМ МАСШТАБЕ: ГЕНЕТИЧЕСКАЯ РЕАЛЬНОСТЬ РАС

Число предковых компонентов принято обозначать k. <...> Так, на низких k выделяются континент-специфичные генофонды, а при их увеличении выделяются давно известные из антропологических и геногеографических работ ареалы сходных популяций внутри континентов.

Наиболее репрезентативно исследование [Pagani et al., submitted], основанное на секвенировании полных геномов, и поэтому набор использованных SNP-маркеров не смещен в сторону европейских популяций, как это свойственно большинству широкогеномных панелей. В этой работе к тому же проанализировано большое число популяций изо всех основных регионов мира.


В результате при k=2 один компонент включил все популяции Африки и Западной Евразии, а другой – все популяции Восточной Евразии и Америки.

При увеличении до k=3 западно-евразийские и африканские популяции разделяются на отдельные компоненты.

При k=4 выделяется отдельный компонент, доминирующий в популяциях американских индейцев, но также составляющий около половины генофонда и в Сибири (остальная часть сибирского генофонда приходится на восточно-евразийский и в меньшей мере на западно-евразийский компоненты).

Но уже при k=5 население Сибири приобретает свой собственный компонент, вбирающий основную часть сибирского генофонда.

При k=6 население Сахула (Австралия + Папуа Новая Гвинея, правда, представленное в этом исследовании лишь папуасскими популяциями), приобретает свой собственный компонент. До этого оно было частью восточноевразийского компонента, а после отделения сибирского – частью оставшегося восточноазиатского компонента.

Эта картина удивительно схожа (чтобы не сказать совпадает) с традиционной расовой классификацией. Ведь при k=3 мы, по сути, видим привычное со школы деление на три большие расы — негроидов, европеоидов и монголоидов. А если физическим антропологам сказать, что требуется разделить все антропологическое многообразие на 4 группы, тогда большинство из них выделит американоидную расу из состава монголоидной. Небольшое отличие от антропологических классификаций состоит в том, что австралоидная раса приобретает свой собственный компонент лишь начиная с k=6, тогда как в традиционных расовых классификациях австралоидная раса имеет чуть более высокий иерархический статус. Поразительно и печально, что при таком полном подтверждении традиционных расовых классификаций новейшими генетическими данными, до сих пор широко распространено мнение, что генетика «доказала» отсутствие рас. Впрочем, об этом уже давно писалось [Раса: миф или реальность, 1998].

Все эти расы, выделившиеся при k=6 (негроидная, европеоидная, америндская, северомонголоидная, южномонголоидная, австралоидная), продолжают существовать и при более высоких k, лишь при каждом его повышении какая-то из них дробится на два компонента.

Так, при k=7 из европеоидного (западноевразийского) компонента выделяется южноазиатстко-ближневосточный, который при k=8 разделяется на ближневосточный и южноазиатский (индийский), при k=9 выделяется компонент северо-восточной Сибири, при k=10 начинает дробиться негроидная раса и так далее.

АНАЛИЗ В ЕВРОПЕЙСКОМ МАСШТАБЕ

Но вернемся к генофонду Европы. В ходе анализа генофонда балто-славянских народов был проведен анализ ADMIXTURE, включивший не только балтов и славян, но и остальные изученные по широкогеномным маркерам популяции Европы, и, в несколько меньшей мере, популяции других регионов мира. Это позволяет нам воспользоваться этими результатами для анализа в европейском масштабе.

Приведем карты распространения предковых компонентов, полученных при контрастных величинах k, равных 6 и 18. Первый вариант близок к разумному минимуму, поскольку делит все генофонды Старого Света на шесть основных доменов: африканский домен, два домена в северной половине Евразии (европейский и сибирский), и три домена в южной половине Евразии (средиземноморский, южноазиатский и восточноазиатский). Это те регионы мира, которые выделяются и географически, и известны из предшествовавших геногеографических работ, что подтверждает осмысленность результатов, получаемых методом ADMIXTURE. Второй вариант (k=18) близок к максимуму, поскольку при таких высоких k многие популяции приобретают «собственные» компоненты, и картина становится чрезвычайно дробной.

Чтобы различать предковые компоненты, выделенные при k=6 и k=18, будем далее обозначать их в первом случае (k=6) как 6.1, 6.2, … 6.5, 6.6; а во втором случае (k=18) как 18.1, 18.2, …. 18.17, 18.18.

РАСПРОСТРАНЕНИЕ ПРЕДКОВЫХ КОМПОНЕНТОВ ПРИ K=6

На рисунке 4.4 картографировано распространение по Европе и смежным регионам всех шести предковых компонентов, выделяемых при k=6. Поскольку они выделены в масштабе мира, максимумы только двух из них приходятся на изучаемый регион – это североевропейский и средиземноморский компоненты. Геногеографические карты всех шести основных компонентов, в разной мере созидающих генофонд Европы, позволяют объективно оценить и степень влияния, и регионы их влияния (рис. 4.4. А-Е).

Североевропейский компонент (6.1, рис. 4.4.А) охватывает всю Европу, но максимума достигает на территориях вокруг Балтийского моря, где составляет более 90% генофонда. Паттерн его распространения поразительно сходен – почти совпадает – с распространением светлой пигментации волос и глаз. Это ведущий антропологический признак выделения североевропеоидной малой расы, и этот генетический компонент, по всей видимости, совпадает с антропологическим компонентом, давно уже выделенным в физической антропологии.

Средиземноморский компонент (6.2, рис. 4.4.Б) составляет более трети генофонда на европейском побережье и более половины генофонда – на азиатском и африканском побережьях Средиземного моря.

В Европе доля североевропейского компонента снижается к югу, а доля средиземноморского навстречу ему – к северу. Но в целом североевропейский компонент преобладает по всей Европе: даже на южных полуостровах Европы он составляет большую долю генофонда, чем средиземноморский предковый компонент. Центр тяжести средиземноморского компонента приходится на Юго-Западную Азию. Его можно сопоставить с южноевропеоидной (средиземноморской) малой расой. Основное отличие от нее кроется за пределами картографированного ареала – ареал средиземноморской малой расы включает и Индостан, тогда как генетический предковый компонент в Индостане свой, равноправный средиземноморскому.

Впрочем, и средиземноморский компонент заходит в Индостан, и индийский (южноазиатский) компонент заходит в Средиземноморье.

Южноазиатский компонент (6.3, рис. 4.4.В) в пределах Европы наиболее выражен на Северном Кавказе, где составляет около трети генофонда. Примерно так же он выражен и по всей Юго-Западной Азии. Заметную долю генофонда (10-15%) он составляет на Балканском и Аппенинском полуостровах и в южных частях Центральной Европы, но далее к северу не распространяется, и вокруг Балтийского моря почти полностью отсутствует.

Сибирский компонент (6.4, рис. 4.4.Г). Примерно с той же степенью влияния, как и южноазиатский компонент, в Европе представлен и сибирский. На отдельных территориях (на южном Урале) он составляет более четверти генофонда, но чуть западнее у народов Поволжья частота его уже снижается, далее к западу на основной части Восточно-Европейской равнины он составляет совсем небольшую часть генофонда, а еще западнее – в Центральной и Западной Европе – практически отсутствует.

Что касается двух оставшихся компонентов мирового генофонда, то их доля в европейском генофонде ничтожна.

Восточноазиатский компонент (6.5, рис. 4.4.Е) составляет от 1 до 5% процентов у отдельных народов Урала, Поволжья и Восточного Кавказа, но отсут

ствует на всей остальной территории Европы.

Африканский компонент (6.6, рис. 4.4.Д) сходным образом составляет пару процентов генофонда Пиренейского полуострова, и отсутствует на остальной территории Европы.

Олег Балановский
http://генофонд.рф/